Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXM1

LRIG3, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG3Q6UXM1 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LRIG3Q6UXM1 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LRIG3Q6UXM1 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LRIG3Q6UXM1 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LRIG3Q6UXM1 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LRIG3Q6UXM1 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LRIG3Q6UXM1 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LRIG3Q6UXM1 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LRIG3Q6UXM1 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LRIG3Q6UXM1 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LRIG3Q6UXM1 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LRIG3Q6UXM1 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LRIG3Q6UXM1 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LRIG3Q6UXM1 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LRIG3Q6UXM1 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LRIG3Q6UXM1 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LRIG3Q6UXM1 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LRIG3Q6UXM1 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
LRIG3Q6UXM1 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LRIG3Q6UXM1 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LRIG3Q6UXM1 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LRIG3Q6UXM1 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LRIG3Q6UXM1 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LRIG3Q6UXM1 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LRIG3Q6UXM1 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
LRIG3Q6UXM1 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LRIG3Q6UXM1 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LRIG3Q6UXM1 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LRIG3Q6UXM1 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LRIG3Q6UXM1 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LRIG3Q6UXM1 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LRIG3Q6UXM1 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LRIG3Q6UXM1 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LRIG3Q6UXM1 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
LRIG3Q6UXM1 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LRIG3Q6UXM1 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LRIG3Q6UXM1 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
LRIG3Q6UXM1 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
LRIG3Q6UXM1 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LRIG3Q6UXM1 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LRIG3Q6UXM1 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
LRIG3Q6UXM1 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LRIG3Q6UXM1 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LRIG3Q6UXM1 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LRIG3Q6UXM1 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
LRIG3Q6UXM1 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
LRIG3Q6UXM1 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
LRIG3Q6UXM1 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
LRIG3Q6UXM1 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
LRIG3Q6UXM1 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
LRIG3Q6UXM1 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
LRIG3Q6UXM1 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
LRIG3Q6UXM1 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
LRIG3Q6UXM1 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
LRIG3Q6UXM1 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
LRIG3Q6UXM1 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LRIG3Q6UXM1 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LRIG3Q6UXM1 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LRIG3Q6UXM1 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LRIG3Q6UXM1 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
LRIG3Q6UXM1 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
LRIG3Q6UXM1 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
LRIG3Q6UXM1 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
LRIG3Q6UXM1 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
LRIG3Q6UXM1 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LRIG3Q6UXM1 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LRIG3Q6UXM1 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LRIG3Q6UXM1 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LRIG3Q6UXM1 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LRIG3Q6UXM1 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LRIG3Q6UXM1 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
LRIG3Q6UXM1 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
LRIG3Q6UXM1 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
LRIG3Q6UXM1 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LRIG3Q6UXM1 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LRIG3Q6UXM1 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LRIG3Q6UXM1 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LRIG3Q6UXM1 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LRIG3Q6UXM1 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LRIG3Q6UXM1 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
LRIG3Q6UXM1 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
LRIG3Q6UXM1 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LRIG3Q6UXM1 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
LRIG3Q6UXM1 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LRIG3Q6UXM1 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LRIG3Q6UXM1 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LRIG3Q6UXM1 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
LRIG3Q6UXM1 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LRIG3Q6UXM1 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LRIG3Q6UXM1 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LRIG3Q6UXM1 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LRIG3Q6UXM1 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LRIG3Q6UXM1 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LRIG3Q6UXM1 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LRIG3Q6UXM1 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LRIG3Q6UXM1 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LRIG3Q6UXM1 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
LRIG3Q6UXM1 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LRIG3Q6UXM1 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
LRIG3Q6UXM1 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms