Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXH8

CCBE1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCBE1Q6UXH8 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCBE1Q6UXH8 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCBE1Q6UXH8 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCBE1Q6UXH8 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCBE1Q6UXH8 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCBE1Q6UXH8 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCBE1Q6UXH8 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCBE1Q6UXH8 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCBE1Q6UXH8 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
CCBE1Q6UXH8 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCBE1Q6UXH8 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCBE1Q6UXH8 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCBE1Q6UXH8 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCBE1Q6UXH8 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCBE1Q6UXH8 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCBE1Q6UXH8 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCBE1Q6UXH8 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCBE1Q6UXH8 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCBE1Q6UXH8 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCBE1Q6UXH8 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCBE1Q6UXH8 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCBE1Q6UXH8 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCBE1Q6UXH8 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCBE1Q6UXH8 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCBE1Q6UXH8 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCBE1Q6UXH8 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCBE1Q6UXH8 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCBE1Q6UXH8 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
CCBE1Q6UXH8 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
CCBE1Q6UXH8 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
CCBE1Q6UXH8 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
CCBE1Q6UXH8 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
CCBE1Q6UXH8 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCBE1Q6UXH8 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCBE1Q6UXH8 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCBE1Q6UXH8 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCBE1Q6UXH8 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCBE1Q6UXH8 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCBE1Q6UXH8 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCBE1Q6UXH8 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCBE1Q6UXH8 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCBE1Q6UXH8 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCBE1Q6UXH8 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
CCBE1Q6UXH8 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
CCBE1Q6UXH8 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
CCBE1Q6UXH8 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCBE1Q6UXH8 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCBE1Q6UXH8 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCBE1Q6UXH8 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCBE1Q6UXH8 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCBE1Q6UXH8 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCBE1Q6UXH8 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCBE1Q6UXH8 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCBE1Q6UXH8 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCBE1Q6UXH8 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCBE1Q6UXH8 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCBE1Q6UXH8 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCBE1Q6UXH8 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCBE1Q6UXH8 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCBE1Q6UXH8 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCBE1Q6UXH8 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCBE1Q6UXH8 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCBE1Q6UXH8 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCBE1Q6UXH8 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCBE1Q6UXH8 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCBE1Q6UXH8 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCBE1Q6UXH8 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCBE1Q6UXH8 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCBE1Q6UXH8 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCBE1Q6UXH8 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCBE1Q6UXH8 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCBE1Q6UXH8 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCBE1Q6UXH8 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCBE1Q6UXH8 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCBE1Q6UXH8 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCBE1Q6UXH8 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCBE1Q6UXH8 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCBE1Q6UXH8 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCBE1Q6UXH8 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCBE1Q6UXH8 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCBE1Q6UXH8 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CCBE1Q6UXH8 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCBE1Q6UXH8 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCBE1Q6UXH8 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCBE1Q6UXH8 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCBE1Q6UXH8 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCBE1Q6UXH8 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCBE1Q6UXH8 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCBE1Q6UXH8 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCBE1Q6UXH8 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCBE1Q6UXH8 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCBE1Q6UXH8 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCBE1Q6UXH8 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCBE1Q6UXH8 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCBE1Q6UXH8 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCBE1Q6UXH8 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCBE1Q6UXH8 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCBE1Q6UXH8 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCBE1Q6UXH8 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCBE1Q6UXH8 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms