Protein–RNA interactions for Protein: Q6PF15

KLHL35, Kelch-like protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL35Q6PF15 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KLHL35Q6PF15 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KLHL35Q6PF15 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KLHL35Q6PF15 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KLHL35Q6PF15 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KLHL35Q6PF15 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KLHL35Q6PF15 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KLHL35Q6PF15 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KLHL35Q6PF15 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KLHL35Q6PF15 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KLHL35Q6PF15 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLHL35Q6PF15 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLHL35Q6PF15 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLHL35Q6PF15 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLHL35Q6PF15 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLHL35Q6PF15 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLHL35Q6PF15 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLHL35Q6PF15 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLHL35Q6PF15 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLHL35Q6PF15 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLHL35Q6PF15 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLHL35Q6PF15 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLHL35Q6PF15 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
KLHL35Q6PF15 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLHL35Q6PF15 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLHL35Q6PF15 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLHL35Q6PF15 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLHL35Q6PF15 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLHL35Q6PF15 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLHL35Q6PF15 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLHL35Q6PF15 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLHL35Q6PF15 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLHL35Q6PF15 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLHL35Q6PF15 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLHL35Q6PF15 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLHL35Q6PF15 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHL35Q6PF15 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHL35Q6PF15 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHL35Q6PF15 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHL35Q6PF15 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHL35Q6PF15 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHL35Q6PF15 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHL35Q6PF15 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHL35Q6PF15 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHL35Q6PF15 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHL35Q6PF15 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHL35Q6PF15 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHL35Q6PF15 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHL35Q6PF15 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHL35Q6PF15 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHL35Q6PF15 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHL35Q6PF15 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHL35Q6PF15 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHL35Q6PF15 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHL35Q6PF15 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHL35Q6PF15 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHL35Q6PF15 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHL35Q6PF15 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHL35Q6PF15 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHL35Q6PF15 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHL35Q6PF15 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHL35Q6PF15 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
KLHL35Q6PF15 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL35Q6PF15 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL35Q6PF15 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL35Q6PF15 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL35Q6PF15 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL35Q6PF15 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL35Q6PF15 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL35Q6PF15 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL35Q6PF15 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL35Q6PF15 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL35Q6PF15 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL35Q6PF15 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL35Q6PF15 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL35Q6PF15 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL35Q6PF15 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL35Q6PF15 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL35Q6PF15 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL35Q6PF15 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL35Q6PF15 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL35Q6PF15 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL35Q6PF15 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL35Q6PF15 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL35Q6PF15 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL35Q6PF15 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL35Q6PF15 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL35Q6PF15 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL35Q6PF15 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL35Q6PF15 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL35Q6PF15 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL35Q6PF15 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL35Q6PF15 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL35Q6PF15 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL35Q6PF15 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL35Q6PF15 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL35Q6PF15 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL35Q6PF15 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL35Q6PF15 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL35Q6PF15 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms