Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWN6

FAM208B, Protein FAM208B, humanhuman

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Length 2,430 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM208BQ5VWN6 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
FAM208BQ5VWN6 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
FAM208BQ5VWN6 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
FAM208BQ5VWN6 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
FAM208BQ5VWN6 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FAM208BQ5VWN6 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
FAM208BQ5VWN6 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
FAM208BQ5VWN6 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
FAM208BQ5VWN6 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FAM208BQ5VWN6 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
FAM208BQ5VWN6 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FAM208BQ5VWN6 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
FAM208BQ5VWN6 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
FAM208BQ5VWN6 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FAM208BQ5VWN6 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FAM208BQ5VWN6 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FAM208BQ5VWN6 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FAM208BQ5VWN6 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
FAM208BQ5VWN6 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FAM208BQ5VWN6 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
FAM208BQ5VWN6 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
FAM208BQ5VWN6 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
FAM208BQ5VWN6 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
FAM208BQ5VWN6 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
FAM208BQ5VWN6 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FAM208BQ5VWN6 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
FAM208BQ5VWN6 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
FAM208BQ5VWN6 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
FAM208BQ5VWN6 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FAM208BQ5VWN6 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FAM208BQ5VWN6 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FAM208BQ5VWN6 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FAM208BQ5VWN6 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FAM208BQ5VWN6 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FAM208BQ5VWN6 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FAM208BQ5VWN6 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FAM208BQ5VWN6 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FAM208BQ5VWN6 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FAM208BQ5VWN6 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FAM208BQ5VWN6 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FAM208BQ5VWN6 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FAM208BQ5VWN6 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FAM208BQ5VWN6 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FAM208BQ5VWN6 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FAM208BQ5VWN6 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FAM208BQ5VWN6 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FAM208BQ5VWN6 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FAM208BQ5VWN6 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FAM208BQ5VWN6 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
FAM208BQ5VWN6 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
FAM208BQ5VWN6 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FAM208BQ5VWN6 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FAM208BQ5VWN6 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
FAM208BQ5VWN6 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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FAM208BQ5VWN6 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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FAM208BQ5VWN6 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
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FAM208BQ5VWN6 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FAM208BQ5VWN6 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FAM208BQ5VWN6 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FAM208BQ5VWN6 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FAM208BQ5VWN6 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FAM208BQ5VWN6 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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FAM208BQ5VWN6 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FAM208BQ5VWN6 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
FAM208BQ5VWN6 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
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FAM208BQ5VWN6 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
FAM208BQ5VWN6 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FAM208BQ5VWN6 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FAM208BQ5VWN6 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
FAM208BQ5VWN6 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FAM208BQ5VWN6 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FAM208BQ5VWN6 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FAM208BQ5VWN6 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
FAM208BQ5VWN6 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
FAM208BQ5VWN6 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FAM208BQ5VWN6 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FAM208BQ5VWN6 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FAM208BQ5VWN6 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FAM208BQ5VWN6 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FAM208BQ5VWN6 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
FAM208BQ5VWN6 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FAM208BQ5VWN6 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FAM208BQ5VWN6 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FAM208BQ5VWN6 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
FAM208BQ5VWN6 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
FAM208BQ5VWN6 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
FAM208BQ5VWN6 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FAM208BQ5VWN6 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
FAM208BQ5VWN6 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
FAM208BQ5VWN6 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FAM208BQ5VWN6 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FAM208BQ5VWN6 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FAM208BQ5VWN6 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
FAM208BQ5VWN6 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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