Protein–RNA interactions for Protein: Q5VU97

CACHD1, VWFA and cache domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 1,274 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACHD1Q5VU97 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CACHD1Q5VU97 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CACHD1Q5VU97 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CACHD1Q5VU97 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CACHD1Q5VU97 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CACHD1Q5VU97 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CACHD1Q5VU97 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CACHD1Q5VU97 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CACHD1Q5VU97 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CACHD1Q5VU97 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CACHD1Q5VU97 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CACHD1Q5VU97 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CACHD1Q5VU97 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CACHD1Q5VU97 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CACHD1Q5VU97 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CACHD1Q5VU97 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CACHD1Q5VU97 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CACHD1Q5VU97 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CACHD1Q5VU97 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CACHD1Q5VU97 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CACHD1Q5VU97 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CACHD1Q5VU97 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CACHD1Q5VU97 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CACHD1Q5VU97 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CACHD1Q5VU97 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CACHD1Q5VU97 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CACHD1Q5VU97 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CACHD1Q5VU97 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CACHD1Q5VU97 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CACHD1Q5VU97 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CACHD1Q5VU97 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CACHD1Q5VU97 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CACHD1Q5VU97 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CACHD1Q5VU97 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CACHD1Q5VU97 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CACHD1Q5VU97 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CACHD1Q5VU97 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CACHD1Q5VU97 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CACHD1Q5VU97 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CACHD1Q5VU97 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CACHD1Q5VU97 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CACHD1Q5VU97 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CACHD1Q5VU97 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CACHD1Q5VU97 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CACHD1Q5VU97 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CACHD1Q5VU97 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CACHD1Q5VU97 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CACHD1Q5VU97 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CACHD1Q5VU97 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CACHD1Q5VU97 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CACHD1Q5VU97 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CACHD1Q5VU97 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CACHD1Q5VU97 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CACHD1Q5VU97 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CACHD1Q5VU97 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CACHD1Q5VU97 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CACHD1Q5VU97 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CACHD1Q5VU97 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CACHD1Q5VU97 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CACHD1Q5VU97 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CACHD1Q5VU97 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CACHD1Q5VU97 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CACHD1Q5VU97 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CACHD1Q5VU97 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CACHD1Q5VU97 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CACHD1Q5VU97 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CACHD1Q5VU97 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CACHD1Q5VU97 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CACHD1Q5VU97 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CACHD1Q5VU97 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CACHD1Q5VU97 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACHD1Q5VU97 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACHD1Q5VU97 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACHD1Q5VU97 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACHD1Q5VU97 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACHD1Q5VU97 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACHD1Q5VU97 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACHD1Q5VU97 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACHD1Q5VU97 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACHD1Q5VU97 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACHD1Q5VU97 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACHD1Q5VU97 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACHD1Q5VU97 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACHD1Q5VU97 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACHD1Q5VU97 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACHD1Q5VU97 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACHD1Q5VU97 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACHD1Q5VU97 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CACHD1Q5VU97 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACHD1Q5VU97 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACHD1Q5VU97 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CACHD1Q5VU97 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACHD1Q5VU97 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACHD1Q5VU97 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACHD1Q5VU97 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACHD1Q5VU97 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACHD1Q5VU97 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACHD1Q5VU97 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACHD1Q5VU97 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACHD1Q5VU97 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
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