Protein–RNA interactions for Protein: Q56UQ5

TPT1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q56UQ5 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q56UQ5 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q56UQ5 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q56UQ5 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q56UQ5 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Q56UQ5 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q56UQ5 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q56UQ5 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q56UQ5 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q56UQ5 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q56UQ5 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q56UQ5 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q56UQ5 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q56UQ5 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q56UQ5 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q56UQ5 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Q56UQ5 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q56UQ5 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q56UQ5 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q56UQ5 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q56UQ5 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q56UQ5 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q56UQ5 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Q56UQ5 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q56UQ5 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q56UQ5 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q56UQ5 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q56UQ5 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q56UQ5 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q56UQ5 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q56UQ5 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q56UQ5 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q56UQ5 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q56UQ5 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q56UQ5 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q56UQ5 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q56UQ5 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q56UQ5 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q56UQ5 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q56UQ5 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q56UQ5 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q56UQ5 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q56UQ5 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q56UQ5 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q56UQ5 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q56UQ5 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q56UQ5 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Q56UQ5 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q56UQ5 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q56UQ5 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q56UQ5 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q56UQ5 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q56UQ5 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q56UQ5 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q56UQ5 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q56UQ5 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Q56UQ5 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q56UQ5 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q56UQ5 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q56UQ5 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q56UQ5 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q56UQ5 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q56UQ5 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q56UQ5 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q56UQ5 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q56UQ5 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q56UQ5 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q56UQ5 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q56UQ5 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Q56UQ5 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q56UQ5 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q56UQ5 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q56UQ5 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q56UQ5 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q56UQ5 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q56UQ5 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q56UQ5 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q56UQ5 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q56UQ5 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q56UQ5 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q56UQ5 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q56UQ5 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q56UQ5 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q56UQ5 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q56UQ5 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Q56UQ5 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q56UQ5 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q56UQ5 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q56UQ5 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q56UQ5 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q56UQ5 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q56UQ5 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q56UQ5 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q56UQ5 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q56UQ5 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q56UQ5 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q56UQ5 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Q56UQ5 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q56UQ5 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q56UQ5 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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