Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI58

KRTAP21-1, Keratin-associated protein 21-1, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-1Q3LI58 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 LINC00926-202ENST00000502027 2141 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms