Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RTL8BQ17RB0 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RTL8BQ17RB0 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RTL8BQ17RB0 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RTL8BQ17RB0 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RTL8BQ17RB0 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RTL8BQ17RB0 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RTL8BQ17RB0 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RTL8BQ17RB0 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
RTL8BQ17RB0 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RTL8BQ17RB0 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RTL8BQ17RB0 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RTL8BQ17RB0 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RTL8BQ17RB0 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
RTL8BQ17RB0 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RTL8BQ17RB0 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RTL8BQ17RB0 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RTL8BQ17RB0 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RTL8BQ17RB0 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RTL8BQ17RB0 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
RTL8BQ17RB0 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RTL8BQ17RB0 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RTL8BQ17RB0 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
RTL8BQ17RB0 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RTL8BQ17RB0 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RTL8BQ17RB0 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RTL8BQ17RB0 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RTL8BQ17RB0 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RTL8BQ17RB0 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RTL8BQ17RB0 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RTL8BQ17RB0 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RTL8BQ17RB0 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RTL8BQ17RB0 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RTL8BQ17RB0 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RTL8BQ17RB0 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RTL8BQ17RB0 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RTL8BQ17RB0 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RTL8BQ17RB0 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RTL8BQ17RB0 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RTL8BQ17RB0 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
RTL8BQ17RB0 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RTL8BQ17RB0 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RTL8BQ17RB0 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RTL8BQ17RB0 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RTL8BQ17RB0 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RTL8BQ17RB0 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RTL8BQ17RB0 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
RTL8BQ17RB0 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RTL8BQ17RB0 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RTL8BQ17RB0 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RTL8BQ17RB0 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RTL8BQ17RB0 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RTL8BQ17RB0 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RTL8BQ17RB0 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RTL8BQ17RB0 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RTL8BQ17RB0 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RTL8BQ17RB0 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RTL8BQ17RB0 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RTL8BQ17RB0 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RTL8BQ17RB0 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RTL8BQ17RB0 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RTL8BQ17RB0 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RTL8BQ17RB0 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RTL8BQ17RB0 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RTL8BQ17RB0 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RTL8BQ17RB0 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RTL8BQ17RB0 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RTL8BQ17RB0 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RTL8BQ17RB0 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RTL8BQ17RB0 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RTL8BQ17RB0 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RTL8BQ17RB0 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RTL8BQ17RB0 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RTL8BQ17RB0 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RTL8BQ17RB0 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RTL8BQ17RB0 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
RTL8BQ17RB0 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RTL8BQ17RB0 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RTL8BQ17RB0 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RTL8BQ17RB0 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RTL8BQ17RB0 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
RTL8BQ17RB0 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RTL8BQ17RB0 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RTL8BQ17RB0 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RTL8BQ17RB0 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RTL8BQ17RB0 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RTL8BQ17RB0 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RTL8BQ17RB0 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RTL8BQ17RB0 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
RTL8BQ17RB0 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RTL8BQ17RB0 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RTL8BQ17RB0 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RTL8BQ17RB0 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RTL8BQ17RB0 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RTL8BQ17RB0 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RTL8BQ17RB0 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RTL8BQ17RB0 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RTL8BQ17RB0 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RTL8BQ17RB0 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RTL8BQ17RB0 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
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