Protein–RNA interactions for Protein: Q16586

SGCA, Alpha-sarcoglycan, humanhuman

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Length 387 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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SGCAQ16586 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SGCAQ16586 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SGCAQ16586 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SGCAQ16586 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SGCAQ16586 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SGCAQ16586 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
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SGCAQ16586 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SGCAQ16586 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
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SGCAQ16586 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
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SGCAQ16586 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SGCAQ16586 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SGCAQ16586 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SGCAQ16586 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SGCAQ16586 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SGCAQ16586 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SGCAQ16586 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SGCAQ16586 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SGCAQ16586 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SGCAQ16586 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SGCAQ16586 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SGCAQ16586 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SGCAQ16586 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
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SGCAQ16586 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
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SGCAQ16586 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SGCAQ16586 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SGCAQ16586 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SGCAQ16586 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SGCAQ16586 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SGCAQ16586 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SGCAQ16586 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
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