Protein–RNA interactions for Protein: Q15699

ALX1, ALX homeobox protein 1, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALX1Q15699 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ALX1Q15699 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ALX1Q15699 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ALX1Q15699 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ALX1Q15699 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ALX1Q15699 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ALX1Q15699 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ALX1Q15699 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ALX1Q15699 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ALX1Q15699 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ALX1Q15699 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ALX1Q15699 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ALX1Q15699 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ALX1Q15699 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ALX1Q15699 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ALX1Q15699 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ALX1Q15699 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ALX1Q15699 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ALX1Q15699 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ALX1Q15699 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ALX1Q15699 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ALX1Q15699 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ALX1Q15699 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ALX1Q15699 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ALX1Q15699 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ALX1Q15699 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ALX1Q15699 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ALX1Q15699 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ALX1Q15699 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ALX1Q15699 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ALX1Q15699 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ALX1Q15699 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ALX1Q15699 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ALX1Q15699 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ALX1Q15699 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ALX1Q15699 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ALX1Q15699 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ALX1Q15699 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ALX1Q15699 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ALX1Q15699 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ALX1Q15699 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ALX1Q15699 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ALX1Q15699 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ALX1Q15699 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ALX1Q15699 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ALX1Q15699 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ALX1Q15699 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ALX1Q15699 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ALX1Q15699 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ALX1Q15699 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ALX1Q15699 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ALX1Q15699 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ALX1Q15699 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ALX1Q15699 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ALX1Q15699 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ALX1Q15699 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ALX1Q15699 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ALX1Q15699 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ALX1Q15699 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ALX1Q15699 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ALX1Q15699 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ALX1Q15699 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ALX1Q15699 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ALX1Q15699 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ALX1Q15699 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ALX1Q15699 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ALX1Q15699 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ALX1Q15699 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ALX1Q15699 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ALX1Q15699 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ALX1Q15699 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ALX1Q15699 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ALX1Q15699 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ALX1Q15699 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ALX1Q15699 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ALX1Q15699 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ALX1Q15699 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ALX1Q15699 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ALX1Q15699 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ALX1Q15699 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ALX1Q15699 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ALX1Q15699 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ALX1Q15699 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ALX1Q15699 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ALX1Q15699 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ALX1Q15699 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ALX1Q15699 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ALX1Q15699 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ALX1Q15699 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ALX1Q15699 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ALX1Q15699 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ALX1Q15699 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ALX1Q15699 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ALX1Q15699 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ALX1Q15699 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ALX1Q15699 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ALX1Q15699 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ALX1Q15699 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ALX1Q15699 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ALX1Q15699 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
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