Protein–RNA interactions for Protein: Q15366

PCBP2, Poly(rC)-binding protein 2, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP2Q15366 WASHC4-214ENST00000620430 5807 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.434e-6■■■■■ 27.9
PCBP2Q15366 WASHC4-202ENST00000332180 5812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.464e-6■■■■■ 27.9
PCBP2Q15366 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.732e-6■■■■■ 27.9
PCBP2Q15366 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.692e-6■■■■■ 27.9
PCBP2Q15366 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.172e-6■■■■■ 27.9
PCBP2Q15366 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.152e-6■■■■■ 27.9
PCBP2Q15366 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.042e-6■■■■■ 27.9
PCBP2Q15366 DGKZ-215ENST00000528173 5737 ntTSL 514.78□□□□□ -0.042e-6■■■■■ 27.9
PCBP2Q15366 DGKZ-216ENST00000528615 2692 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.322e-6■■■■■ 27.9
PCBP2Q15366 DGKZ-204ENST00000454345 4086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.332e-6■■■■■ 27.9
PCBP2Q15366 DGKZ-217ENST00000529660 493 ntTSL 512.88□□□□□ -0.352e-6■■■■■ 27.9
PCBP2Q15366 DGKZ-219ENST00000531879 2922 ntTSL 212.78□□□□□ -0.362e-6■■■■■ 27.9
PCBP2Q15366 DGKZ-208ENST00000524984 3512 ntTSL 212.68□□□□□ -0.382e-6■■■■■ 27.9
PCBP2Q15366 DGKZ-211ENST00000527211 3679 ntTSL 1 (best)11.98□□□□□ -0.492e-6■■■■■ 27.9
PCBP2Q15366 DGKZ-220ENST00000532868 3118 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.542e-6■■■■■ 27.9
PCBP2Q15366 SRRM2-230ENST00000576924 3314 ntTSL 1 (best)16.3■□□□□ 0.29e-20■■■■■ 27.9
PCBP2Q15366 SRRM2-208ENST00000571378 2870 ntTSL 1 (best)14.55□□□□□ -0.089e-20■■■■■ 27.9
PCBP2Q15366 SRRM2-209ENST00000572278 711 ntTSL 29.67□□□□□ -0.869e-20■■■■■ 27.9
PCBP2Q15366 SRRM2-215ENST00000573498 994 ntTSL 35.85□□□□□ -1.479e-20■■■■■ 27.9
PCBP2Q15366 NHSL1-207ENST00000491526 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 313.19□□□□□ -0.38e-7■■■■■ 27.9
PCBP2Q15366 NSD2-219ENST00000508803 4251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.068e-7■■■■■ 27.9
PCBP2Q15366 NSD2-224ENST00000514045 3964 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.148e-7■■■■■ 27.9
PCBP2Q15366 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.392e-7■■■■■ 27.9
PCBP2Q15366 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.342e-7■■■■■ 27.9
PCBP2Q15366 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.239e-7■■■■■ 27.9
PCBP2Q15366 ACTN4-211ENST00000589528 441 ntTSL 214.04□□□□□ -0.169e-7■■■■■ 27.9
PCBP2Q15366 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.446e-9■■■■■ 27.9
PCBP2Q15366 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.176e-9■■■■■ 27.9
PCBP2Q15366 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.036e-9■■■■■ 27.9
PCBP2Q15366 FOXN3-204ENST00000553840 555 ntTSL 416.52■□□□□ 0.241e-6■■■■■ 27.9
PCBP2Q15366 FOXN3-219ENST00000615335 2421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.411e-6■■■■■ 27.9
PCBP2Q15366 FOXN3-201ENST00000261302 2542 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.491e-6■■■■■ 27.9
PCBP2Q15366 FOXN3-218ENST00000557718 398 ntTSL 55.73□□□□□ -1.491e-6■■■■■ 27.9
PCBP2Q15366 FOXN3-213ENST00000556916 467 ntTSL 34.39□□□□□ -1.711e-6■■■■■ 27.9
PCBP2Q15366 FOXN3-203ENST00000553353 366 ntTSL 33.16□□□□□ -1.91e-6■■■■■ 27.9
PCBP2Q15366 RPTOR-208ENST00000574767 2461 ntTSL 215.7■□□□□ 0.12e-6■■■■■ 27.9
PCBP2Q15366 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.069e-7■■■■■ 27.9
PCBP2Q15366 TRIM28-204ENST00000594806 861 ntTSL 524.57■■□□□ 1.522e-8■■■■■ 27.9
PCBP2Q15366 C7orf50-208ENST00000491163 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 318.88■□□□□ 0.619e-7■■■■■ 27.9
PCBP2Q15366 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.559e-7■■■■■ 27.9
PCBP2Q15366 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.529e-7■■■■■ 27.9
PCBP2Q15366 C7orf50-207ENST00000488073 853 ntTSL 517.01■□□□□ 0.319e-7■■■■■ 27.9
PCBP2Q15366 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.192e-6■■■■■ 27.9
PCBP2Q15366 STX4-217ENST00000613541 649 ntTSL 215.75■□□□□ 0.119e-24■■■■■ 27.9
PCBP2Q15366 TRIM28-203ENST00000593582 533 ntTSL 314.29□□□□□ -0.122e-8■■■■■ 27.9
PCBP2Q15366 TEAD1-207ENST00000638666 1281 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.756e-7■■■■■ 27.9
PCBP2Q15366 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.749e-8■■■■■ 27.8
PCBP2Q15366 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.449e-8■■■■■ 27.8
PCBP2Q15366 CHN2-214ENST00000439711 755 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.446e-7■■■■■ 27.8
PCBP2Q15366 CHN2-209ENST00000421775 825 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.696e-7■■■■■ 27.8
PCBP2Q15366 CHN2-202ENST00000409041 2375 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.716e-7■■■■■ 27.8
PCBP2Q15366 CHN2-218ENST00000467441 687 ntTSL 49.86□□□□□ -0.836e-7■■■■■ 27.8
PCBP2Q15366 CHN2-225ENST00000493906 552 ntTSL 49.45□□□□□ -0.96e-7■■■■■ 27.8
PCBP2Q15366 CHN2-206ENST00000410098 918 ntTSL 29.24□□□□□ -0.936e-7■■■■■ 27.8
PCBP2Q15366 CHN2-211ENST00000424025 2279 ntTSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.966e-7■■■■■ 27.8
PCBP2Q15366 CHN2-208ENST00000412711 2991 ntTSL 2 BASIC7.83□□□□□ -1.166e-7■■■■■ 27.8
PCBP2Q15366 CHN2-216ENST00000446446 542 ntTSL 46.73□□□□□ -1.336e-7■■■■■ 27.8
PCBP2Q15366 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.421e-6■■■■■ 27.8
PCBP2Q15366 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.421e-6■■■■■ 27.8
PCBP2Q15366 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.062e-16■■■■■ 27.8
PCBP2Q15366 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.448e-7■■■■■ 27.8
PCBP2Q15366 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.418e-7■■■■■ 27.8
PCBP2Q15366 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.288e-7■■■■■ 27.8
PCBP2Q15366 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.018e-7■■■■■ 27.8
PCBP2Q15366 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.068e-7■■■■■ 27.8
PCBP2Q15366 ZCCHC11-210ENST00000473856 2047 ntTSL 1 (best)19.9■□□□□ 0.783e-6■■■■■ 27.8
PCBP2Q15366 ZCCHC11-208ENST00000470626 883 ntTSL 318.73■□□□□ 0.593e-6■■■■■ 27.8
PCBP2Q15366 ZCCHC11-220ENST00000528642 3854 ntTSL 512.28□□□□□ -0.443e-6■■■■■ 27.8
PCBP2Q15366 ZCCHC11-204ENST00000371544 5858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.6□□□□□ -1.033e-6■■■■■ 27.8
PCBP2Q15366 ANPEP-208ENST00000560030 896 ntTSL 513.83□□□□□ -0.21e-15■■■■■ 27.8
PCBP2Q15366 ANPEP-202ENST00000558177 918 ntTSL 37.92□□□□□ -1.141e-15■■■■■ 27.8
PCBP2Q15366 SPATS2L-216ENST00000444012 605 ntTSL 418.16■□□□□ 0.57e-7■■■■■ 27.8
PCBP2Q15366 SPATS2L-211ENST00000423749 771 ntTSL 517.02■□□□□ 0.327e-7■■■■■ 27.8
PCBP2Q15366 SPATS2L-214ENST00000439084 584 ntTSL 313.46□□□□□ -0.257e-7■■■■■ 27.8
PCBP2Q15366 SPATS2L-215ENST00000439395 561 ntTSL 46.76□□□□□ -1.337e-7■■■■■ 27.8
PCBP2Q15366 SEPT9-242ENST00000592098 503 ntTSL 412.64□□□□□ -0.396e-7■■■■■ 27.8
PCBP2Q15366 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.847e-7■■■■■ 27.8
PCBP2Q15366 MPRIP-202ENST00000341712 3846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.284e-7■■■■■ 27.8
PCBP2Q15366 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.451e-6■■■■■ 27.8
PCBP2Q15366 LMNA-219ENST00000502751 570 ntTSL 415.5■□□□□ 0.071e-6■■■■■ 27.8
PCBP2Q15366 BAZ2A-210ENST00000549787 2773 ntTSL 1 (best)12.19□□□□□ -0.468e-12■■■■■ 27.8
PCBP2Q15366 GIGYF2-216ENST00000428883 544 ntTSL 413.53□□□□□ -0.248e-7■■■■■ 27.8
PCBP2Q15366 GIGYF2-225ENST00000463554 1085 ntTSL 512.45□□□□□ -0.428e-7■■■■■ 27.8
PCBP2Q15366 GIGYF2-243ENST00000490229 863 ntTSL 510.84□□□□□ -0.678e-7■■■■■ 27.8
PCBP2Q15366 GIGYF2-218ENST00000430720 561 ntTSL 49.75□□□□□ -0.858e-7■■■■■ 27.8
PCBP2Q15366 GIGYF2-235ENST00000476995 766 ntTSL 58.52□□□□□ -1.058e-7■■■■■ 27.8
PCBP2Q15366 GIGYF2-226ENST00000464402 529 ntTSL 48.46□□□□□ -1.068e-7■■■■■ 27.8
PCBP2Q15366 GIGYF2-244ENST00000490612 567 ntTSL 48.22□□□□□ -1.098e-7■■■■■ 27.8
PCBP2Q15366 GIGYF2-236ENST00000482666 1261 ntTSL 1 (best)7.54□□□□□ -1.28e-7■■■■■ 27.8
PCBP2Q15366 GIGYF2-242ENST00000489328 1116 ntTSL 57.4□□□□□ -1.228e-7■■■■■ 27.8
PCBP2Q15366 GIGYF2-212ENST00000425040 588 ntTSL 47.4□□□□□ -1.228e-7■■■■■ 27.8
PCBP2Q15366 GIGYF2-245ENST00000492910 685 ntTSL 27.36□□□□□ -1.238e-7■■■■■ 27.8
PCBP2Q15366 GIGYF2-223ENST00000456491 466 ntTSL 47.23□□□□□ -1.258e-7■■■■■ 27.8
PCBP2Q15366 GIGYF2-210ENST00000424038 626 ntTSL 37.23□□□□□ -1.258e-7■■■■■ 27.8
PCBP2Q15366 GIGYF2-217ENST00000429187 606 ntTSL 37.23□□□□□ -1.258e-7■■■■■ 27.8
PCBP2Q15366 GIGYF2-238ENST00000483164 577 ntTSL 56.69□□□□□ -1.348e-7■■■■■ 27.8
PCBP2Q15366 GIGYF2-241ENST00000488734 796 ntTSL 36.26□□□□□ -1.418e-7■■■■■ 27.8
PCBP2Q15366 GIGYF2-227ENST00000464805 1196 ntTSL 1 (best)6.13□□□□□ -1.438e-7■■■■■ 27.8
PCBP2Q15366 GIGYF2-233ENST00000475359 825 ntTSL 25.97□□□□□ -1.458e-7■■■■■ 27.8
PCBP2Q15366 GIGYF2-207ENST00000421433 564 ntTSL 55.32□□□□□ -1.568e-7■■■■■ 27.8
Retrieved 100 of 29,421 protein–RNA pairs in 114.8 ms