Protein–RNA interactions for Protein: Q14990

ODF1, Outer dense fiber protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF1Q14990 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
ODF1Q14990 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ODF1Q14990 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ODF1Q14990 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ODF1Q14990 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ODF1Q14990 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
ODF1Q14990 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ODF1Q14990 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ODF1Q14990 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ODF1Q14990 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
ODF1Q14990 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ODF1Q14990 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
ODF1Q14990 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
ODF1Q14990 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
ODF1Q14990 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
ODF1Q14990 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
ODF1Q14990 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
ODF1Q14990 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ODF1Q14990 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
ODF1Q14990 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ODF1Q14990 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ODF1Q14990 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ODF1Q14990 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ODF1Q14990 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ODF1Q14990 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ODF1Q14990 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ODF1Q14990 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ODF1Q14990 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ODF1Q14990 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ODF1Q14990 SULT2A1-201ENST00000222002 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ODF1Q14990 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ODF1Q14990 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
ODF1Q14990 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ODF1Q14990 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ODF1Q14990 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ODF1Q14990 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ODF1Q14990 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ODF1Q14990 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ODF1Q14990 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
ODF1Q14990 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ODF1Q14990 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ODF1Q14990 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ODF1Q14990 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
ODF1Q14990 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ODF1Q14990 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ODF1Q14990 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ODF1Q14990 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ODF1Q14990 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
ODF1Q14990 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ODF1Q14990 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ODF1Q14990 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
ODF1Q14990 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ODF1Q14990 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ODF1Q14990 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ODF1Q14990 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
ODF1Q14990 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ODF1Q14990 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ODF1Q14990 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ODF1Q14990 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ODF1Q14990 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ODF1Q14990 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ODF1Q14990 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ODF1Q14990 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ODF1Q14990 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ODF1Q14990 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ODF1Q14990 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ODF1Q14990 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ODF1Q14990 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ODF1Q14990 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ODF1Q14990 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
ODF1Q14990 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ODF1Q14990 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ODF1Q14990 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ODF1Q14990 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ODF1Q14990 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
ODF1Q14990 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ODF1Q14990 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ODF1Q14990 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ODF1Q14990 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ODF1Q14990 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ODF1Q14990 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
ODF1Q14990 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
ODF1Q14990 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ODF1Q14990 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ODF1Q14990 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ODF1Q14990 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
ODF1Q14990 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ODF1Q14990 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
ODF1Q14990 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ODF1Q14990 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
ODF1Q14990 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
ODF1Q14990 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
ODF1Q14990 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
ODF1Q14990 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
ODF1Q14990 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ODF1Q14990 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
ODF1Q14990 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
ODF1Q14990 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ODF1Q14990 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ODF1Q14990 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms