Protein–RNA interactions for Protein: Q14590

ZNF235, Zinc finger protein 235, humanhuman

Predictions only

Length 738 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF235Q14590 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZNF235Q14590 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZNF235Q14590 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZNF235Q14590 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZNF235Q14590 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
ZNF235Q14590 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZNF235Q14590 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
ZNF235Q14590 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZNF235Q14590 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZNF235Q14590 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZNF235Q14590 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
ZNF235Q14590 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZNF235Q14590 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZNF235Q14590 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZNF235Q14590 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZNF235Q14590 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZNF235Q14590 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZNF235Q14590 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZNF235Q14590 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZNF235Q14590 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZNF235Q14590 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZNF235Q14590 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZNF235Q14590 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZNF235Q14590 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZNF235Q14590 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZNF235Q14590 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZNF235Q14590 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZNF235Q14590 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZNF235Q14590 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZNF235Q14590 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZNF235Q14590 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZNF235Q14590 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZNF235Q14590 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZNF235Q14590 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZNF235Q14590 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZNF235Q14590 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZNF235Q14590 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZNF235Q14590 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZNF235Q14590 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZNF235Q14590 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZNF235Q14590 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZNF235Q14590 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZNF235Q14590 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZNF235Q14590 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZNF235Q14590 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZNF235Q14590 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZNF235Q14590 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZNF235Q14590 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZNF235Q14590 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZNF235Q14590 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
ZNF235Q14590 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZNF235Q14590 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZNF235Q14590 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZNF235Q14590 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZNF235Q14590 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
ZNF235Q14590 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
ZNF235Q14590 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZNF235Q14590 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZNF235Q14590 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZNF235Q14590 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZNF235Q14590 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZNF235Q14590 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZNF235Q14590 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ZNF235Q14590 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
ZNF235Q14590 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ZNF235Q14590 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ZNF235Q14590 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ZNF235Q14590 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ZNF235Q14590 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ZNF235Q14590 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
ZNF235Q14590 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ZNF235Q14590 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ZNF235Q14590 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ZNF235Q14590 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ZNF235Q14590 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ZNF235Q14590 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ZNF235Q14590 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ZNF235Q14590 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ZNF235Q14590 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ZNF235Q14590 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ZNF235Q14590 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZNF235Q14590 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZNF235Q14590 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZNF235Q14590 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZNF235Q14590 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZNF235Q14590 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZNF235Q14590 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZNF235Q14590 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZNF235Q14590 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZNF235Q14590 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZNF235Q14590 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
ZNF235Q14590 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZNF235Q14590 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZNF235Q14590 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZNF235Q14590 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
ZNF235Q14590 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZNF235Q14590 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZNF235Q14590 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZNF235Q14590 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZNF235Q14590 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms