Protein–RNA interactions for Protein: Q14457

BECN1, Beclin-1, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BECN1Q14457 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
BECN1Q14457 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
BECN1Q14457 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BECN1Q14457 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BECN1Q14457 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
BECN1Q14457 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BECN1Q14457 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
BECN1Q14457 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BECN1Q14457 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BECN1Q14457 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BECN1Q14457 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
BECN1Q14457 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
BECN1Q14457 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
BECN1Q14457 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
BECN1Q14457 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
BECN1Q14457 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
BECN1Q14457 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BECN1Q14457 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BECN1Q14457 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BECN1Q14457 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BECN1Q14457 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
BECN1Q14457 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
BECN1Q14457 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BECN1Q14457 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BECN1Q14457 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BECN1Q14457 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
BECN1Q14457 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
BECN1Q14457 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BECN1Q14457 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
BECN1Q14457 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BECN1Q14457 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BECN1Q14457 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BECN1Q14457 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BECN1Q14457 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BECN1Q14457 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BECN1Q14457 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BECN1Q14457 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BECN1Q14457 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BECN1Q14457 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BECN1Q14457 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BECN1Q14457 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BECN1Q14457 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BECN1Q14457 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BECN1Q14457 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BECN1Q14457 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BECN1Q14457 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BECN1Q14457 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BECN1Q14457 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BECN1Q14457 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BECN1Q14457 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BECN1Q14457 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BECN1Q14457 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BECN1Q14457 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BECN1Q14457 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BECN1Q14457 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BECN1Q14457 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BECN1Q14457 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BECN1Q14457 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BECN1Q14457 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BECN1Q14457 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BECN1Q14457 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BECN1Q14457 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BECN1Q14457 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BECN1Q14457 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BECN1Q14457 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
BECN1Q14457 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BECN1Q14457 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BECN1Q14457 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BECN1Q14457 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BECN1Q14457 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BECN1Q14457 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BECN1Q14457 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BECN1Q14457 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BECN1Q14457 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BECN1Q14457 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BECN1Q14457 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
BECN1Q14457 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BECN1Q14457 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
BECN1Q14457 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BECN1Q14457 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BECN1Q14457 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BECN1Q14457 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
BECN1Q14457 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BECN1Q14457 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BECN1Q14457 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BECN1Q14457 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BECN1Q14457 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BECN1Q14457 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BECN1Q14457 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BECN1Q14457 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BECN1Q14457 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BECN1Q14457 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BECN1Q14457 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
BECN1Q14457 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BECN1Q14457 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BECN1Q14457 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BECN1Q14457 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BECN1Q14457 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BECN1Q14457 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BECN1Q14457 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms