Protein–RNA interactions for Protein: Q13884

SNTB1, Beta-1-syntrophin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 538 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNTB1Q13884 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SNTB1Q13884 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
SNTB1Q13884 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SNTB1Q13884 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SNTB1Q13884 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SNTB1Q13884 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SNTB1Q13884 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SNTB1Q13884 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SNTB1Q13884 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SNTB1Q13884 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SNTB1Q13884 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SNTB1Q13884 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SNTB1Q13884 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SNTB1Q13884 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SNTB1Q13884 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SNTB1Q13884 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SNTB1Q13884 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SNTB1Q13884 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SNTB1Q13884 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SNTB1Q13884 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SNTB1Q13884 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SNTB1Q13884 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SNTB1Q13884 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SNTB1Q13884 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SNTB1Q13884 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SNTB1Q13884 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SNTB1Q13884 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SNTB1Q13884 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SNTB1Q13884 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SNTB1Q13884 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SNTB1Q13884 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SNTB1Q13884 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SNTB1Q13884 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SNTB1Q13884 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SNTB1Q13884 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SNTB1Q13884 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SNTB1Q13884 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SNTB1Q13884 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SNTB1Q13884 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SNTB1Q13884 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SNTB1Q13884 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SNTB1Q13884 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SNTB1Q13884 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SNTB1Q13884 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SNTB1Q13884 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SNTB1Q13884 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SNTB1Q13884 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SNTB1Q13884 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SNTB1Q13884 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SNTB1Q13884 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SNTB1Q13884 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SNTB1Q13884 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SNTB1Q13884 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SNTB1Q13884 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNTB1Q13884 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNTB1Q13884 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNTB1Q13884 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SNTB1Q13884 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNTB1Q13884 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNTB1Q13884 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNTB1Q13884 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SNTB1Q13884 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNTB1Q13884 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNTB1Q13884 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNTB1Q13884 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNTB1Q13884 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNTB1Q13884 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNTB1Q13884 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNTB1Q13884 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNTB1Q13884 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNTB1Q13884 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SNTB1Q13884 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNTB1Q13884 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SNTB1Q13884 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNTB1Q13884 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNTB1Q13884 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNTB1Q13884 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNTB1Q13884 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNTB1Q13884 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNTB1Q13884 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNTB1Q13884 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNTB1Q13884 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNTB1Q13884 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNTB1Q13884 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNTB1Q13884 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNTB1Q13884 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNTB1Q13884 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNTB1Q13884 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SNTB1Q13884 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SNTB1Q13884 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SNTB1Q13884 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SNTB1Q13884 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SNTB1Q13884 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SNTB1Q13884 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SNTB1Q13884 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SNTB1Q13884 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SNTB1Q13884 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SNTB1Q13884 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SNTB1Q13884 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SNTB1Q13884 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms