Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

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Length 913 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CUL4BQ13620 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CUL4BQ13620 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
CUL4BQ13620 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CUL4BQ13620 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CUL4BQ13620 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CUL4BQ13620 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CUL4BQ13620 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
CUL4BQ13620 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CUL4BQ13620 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CUL4BQ13620 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CUL4BQ13620 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CUL4BQ13620 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CUL4BQ13620 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CUL4BQ13620 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CUL4BQ13620 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CUL4BQ13620 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CUL4BQ13620 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CUL4BQ13620 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CUL4BQ13620 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CUL4BQ13620 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CUL4BQ13620 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CUL4BQ13620 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CUL4BQ13620 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CUL4BQ13620 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CUL4BQ13620 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CUL4BQ13620 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CUL4BQ13620 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CUL4BQ13620 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CUL4BQ13620 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
CUL4BQ13620 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CUL4BQ13620 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CUL4BQ13620 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CUL4BQ13620 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CUL4BQ13620 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CUL4BQ13620 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
CUL4BQ13620 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CUL4BQ13620 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
CUL4BQ13620 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CUL4BQ13620 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CUL4BQ13620 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CUL4BQ13620 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CUL4BQ13620 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
CUL4BQ13620 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CUL4BQ13620 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CUL4BQ13620 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CUL4BQ13620 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.95
CUL4BQ13620 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CUL4BQ13620 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CUL4BQ13620 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CUL4BQ13620 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CUL4BQ13620 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
CUL4BQ13620 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CUL4BQ13620 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CUL4BQ13620 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CUL4BQ13620 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CUL4BQ13620 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CUL4BQ13620 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CUL4BQ13620 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CUL4BQ13620 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CUL4BQ13620 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CUL4BQ13620 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CUL4BQ13620 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CUL4BQ13620 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CUL4BQ13620 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CUL4BQ13620 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CUL4BQ13620 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CUL4BQ13620 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CUL4BQ13620 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CUL4BQ13620 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CUL4BQ13620 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CUL4BQ13620 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CUL4BQ13620 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CUL4BQ13620 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CUL4BQ13620 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CUL4BQ13620 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CUL4BQ13620 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CUL4BQ13620 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CUL4BQ13620 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CUL4BQ13620 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CUL4BQ13620 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CUL4BQ13620 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CUL4BQ13620 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
CUL4BQ13620 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CUL4BQ13620 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CUL4BQ13620 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CUL4BQ13620 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CUL4BQ13620 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CUL4BQ13620 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CUL4BQ13620 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CUL4BQ13620 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CUL4BQ13620 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CUL4BQ13620 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CUL4BQ13620 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CUL4BQ13620 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CUL4BQ13620 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CUL4BQ13620 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CUL4BQ13620 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CUL4BQ13620 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
CUL4BQ13620 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
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