Protein–RNA interactions for Protein: Q12988

HSPB3, Heat shock protein beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPB3Q12988 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HSPB3Q12988 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HSPB3Q12988 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HSPB3Q12988 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HSPB3Q12988 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HSPB3Q12988 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HSPB3Q12988 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HSPB3Q12988 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HSPB3Q12988 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HSPB3Q12988 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
HSPB3Q12988 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HSPB3Q12988 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
HSPB3Q12988 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HSPB3Q12988 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
HSPB3Q12988 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HSPB3Q12988 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HSPB3Q12988 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
HSPB3Q12988 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HSPB3Q12988 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HSPB3Q12988 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HSPB3Q12988 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HSPB3Q12988 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HSPB3Q12988 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HSPB3Q12988 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
HSPB3Q12988 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HSPB3Q12988 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HSPB3Q12988 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HSPB3Q12988 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HSPB3Q12988 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HSPB3Q12988 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HSPB3Q12988 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HSPB3Q12988 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HSPB3Q12988 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HSPB3Q12988 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HSPB3Q12988 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HSPB3Q12988 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HSPB3Q12988 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HSPB3Q12988 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HSPB3Q12988 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HSPB3Q12988 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HSPB3Q12988 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HSPB3Q12988 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HSPB3Q12988 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HSPB3Q12988 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HSPB3Q12988 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HSPB3Q12988 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HSPB3Q12988 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HSPB3Q12988 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HSPB3Q12988 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HSPB3Q12988 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HSPB3Q12988 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HSPB3Q12988 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HSPB3Q12988 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HSPB3Q12988 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HSPB3Q12988 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HSPB3Q12988 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HSPB3Q12988 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HSPB3Q12988 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HSPB3Q12988 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HSPB3Q12988 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HSPB3Q12988 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HSPB3Q12988 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HSPB3Q12988 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HSPB3Q12988 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HSPB3Q12988 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HSPB3Q12988 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HSPB3Q12988 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HSPB3Q12988 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HSPB3Q12988 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
HSPB3Q12988 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HSPB3Q12988 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HSPB3Q12988 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HSPB3Q12988 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HSPB3Q12988 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HSPB3Q12988 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HSPB3Q12988 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HSPB3Q12988 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HSPB3Q12988 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HSPB3Q12988 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HSPB3Q12988 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HSPB3Q12988 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HSPB3Q12988 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HSPB3Q12988 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HSPB3Q12988 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HSPB3Q12988 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
HSPB3Q12988 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
HSPB3Q12988 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
HSPB3Q12988 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
HSPB3Q12988 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
HSPB3Q12988 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HSPB3Q12988 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HSPB3Q12988 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HSPB3Q12988 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HSPB3Q12988 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HSPB3Q12988 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HSPB3Q12988 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HSPB3Q12988 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HSPB3Q12988 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HSPB3Q12988 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HSPB3Q12988 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms