Protein–RNA interactions for Protein: Q12981

BNIP1, Vesicle transport protein SEC20, humanhuman

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP1Q12981 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
BNIP1Q12981 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
BNIP1Q12981 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BNIP1Q12981 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BNIP1Q12981 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BNIP1Q12981 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BNIP1Q12981 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BNIP1Q12981 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BNIP1Q12981 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BNIP1Q12981 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BNIP1Q12981 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BNIP1Q12981 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BNIP1Q12981 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BNIP1Q12981 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BNIP1Q12981 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BNIP1Q12981 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BNIP1Q12981 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BNIP1Q12981 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BNIP1Q12981 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
BNIP1Q12981 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BNIP1Q12981 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BNIP1Q12981 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BNIP1Q12981 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BNIP1Q12981 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BNIP1Q12981 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BNIP1Q12981 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BNIP1Q12981 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BNIP1Q12981 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BNIP1Q12981 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BNIP1Q12981 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BNIP1Q12981 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BNIP1Q12981 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BNIP1Q12981 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BNIP1Q12981 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BNIP1Q12981 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BNIP1Q12981 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
BNIP1Q12981 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BNIP1Q12981 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BNIP1Q12981 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BNIP1Q12981 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BNIP1Q12981 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BNIP1Q12981 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BNIP1Q12981 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BNIP1Q12981 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BNIP1Q12981 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
BNIP1Q12981 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BNIP1Q12981 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BNIP1Q12981 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BNIP1Q12981 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
BNIP1Q12981 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BNIP1Q12981 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BNIP1Q12981 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BNIP1Q12981 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
BNIP1Q12981 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
BNIP1Q12981 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BNIP1Q12981 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
BNIP1Q12981 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
BNIP1Q12981 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
BNIP1Q12981 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BNIP1Q12981 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
BNIP1Q12981 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BNIP1Q12981 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BNIP1Q12981 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BNIP1Q12981 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BNIP1Q12981 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
BNIP1Q12981 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
BNIP1Q12981 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BNIP1Q12981 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
BNIP1Q12981 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
BNIP1Q12981 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
BNIP1Q12981 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
BNIP1Q12981 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BNIP1Q12981 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
BNIP1Q12981 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BNIP1Q12981 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
BNIP1Q12981 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
BNIP1Q12981 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BNIP1Q12981 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
BNIP1Q12981 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BNIP1Q12981 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
BNIP1Q12981 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
BNIP1Q12981 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BNIP1Q12981 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BNIP1Q12981 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BNIP1Q12981 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BNIP1Q12981 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BNIP1Q12981 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BNIP1Q12981 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
BNIP1Q12981 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BNIP1Q12981 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
BNIP1Q12981 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BNIP1Q12981 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BNIP1Q12981 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BNIP1Q12981 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BNIP1Q12981 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BNIP1Q12981 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BNIP1Q12981 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BNIP1Q12981 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BNIP1Q12981 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BNIP1Q12981 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
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