Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PTP4A2Q12974 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PTP4A2Q12974 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PTP4A2Q12974 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PTP4A2Q12974 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PTP4A2Q12974 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PTP4A2Q12974 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PTP4A2Q12974 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PTP4A2Q12974 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PTP4A2Q12974 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PTP4A2Q12974 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PTP4A2Q12974 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PTP4A2Q12974 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PTP4A2Q12974 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
PTP4A2Q12974 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PTP4A2Q12974 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PTP4A2Q12974 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
PTP4A2Q12974 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PTP4A2Q12974 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PTP4A2Q12974 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PTP4A2Q12974 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PTP4A2Q12974 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
PTP4A2Q12974 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PTP4A2Q12974 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PTP4A2Q12974 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PTP4A2Q12974 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PTP4A2Q12974 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTP4A2Q12974 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTP4A2Q12974 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTP4A2Q12974 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTP4A2Q12974 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTP4A2Q12974 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTP4A2Q12974 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTP4A2Q12974 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTP4A2Q12974 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTP4A2Q12974 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTP4A2Q12974 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTP4A2Q12974 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTP4A2Q12974 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTP4A2Q12974 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTP4A2Q12974 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTP4A2Q12974 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTP4A2Q12974 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTP4A2Q12974 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTP4A2Q12974 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTP4A2Q12974 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTP4A2Q12974 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTP4A2Q12974 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTP4A2Q12974 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PTP4A2Q12974 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PTP4A2Q12974 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PTP4A2Q12974 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
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PTP4A2Q12974 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PTP4A2Q12974 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PTP4A2Q12974 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PTP4A2Q12974 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PTP4A2Q12974 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PTP4A2Q12974 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PTP4A2Q12974 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PTP4A2Q12974 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PTP4A2Q12974 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PTP4A2Q12974 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PTP4A2Q12974 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PTP4A2Q12974 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTP4A2Q12974 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTP4A2Q12974 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTP4A2Q12974 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
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PTP4A2Q12974 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTP4A2Q12974 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTP4A2Q12974 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTP4A2Q12974 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTP4A2Q12974 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTP4A2Q12974 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTP4A2Q12974 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTP4A2Q12974 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
PTP4A2Q12974 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTP4A2Q12974 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTP4A2Q12974 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
PTP4A2Q12974 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTP4A2Q12974 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTP4A2Q12974 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTP4A2Q12974 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTP4A2Q12974 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTP4A2Q12974 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTP4A2Q12974 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTP4A2Q12974 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTP4A2Q12974 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTP4A2Q12974 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTP4A2Q12974 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTP4A2Q12974 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTP4A2Q12974 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTP4A2Q12974 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTP4A2Q12974 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTP4A2Q12974 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTP4A2Q12974 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTP4A2Q12974 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTP4A2Q12974 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTP4A2Q12974 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
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