Protein–RNA interactions for Protein: Q12908

SLC10A2, Ileal sodium/bile acid cotransporter, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC10A2Q12908 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SLC10A2Q12908 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SLC10A2Q12908 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SLC10A2Q12908 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SLC10A2Q12908 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SLC10A2Q12908 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SLC10A2Q12908 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
SLC10A2Q12908 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SLC10A2Q12908 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SLC10A2Q12908 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SLC10A2Q12908 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SLC10A2Q12908 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SLC10A2Q12908 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SLC10A2Q12908 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SLC10A2Q12908 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SLC10A2Q12908 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SLC10A2Q12908 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SLC10A2Q12908 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SLC10A2Q12908 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SLC10A2Q12908 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SLC10A2Q12908 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SLC10A2Q12908 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SLC10A2Q12908 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SLC10A2Q12908 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SLC10A2Q12908 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SLC10A2Q12908 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SLC10A2Q12908 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SLC10A2Q12908 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SLC10A2Q12908 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SLC10A2Q12908 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SLC10A2Q12908 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SLC10A2Q12908 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SLC10A2Q12908 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SLC10A2Q12908 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SLC10A2Q12908 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SLC10A2Q12908 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SLC10A2Q12908 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SLC10A2Q12908 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SLC10A2Q12908 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SLC10A2Q12908 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SLC10A2Q12908 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SLC10A2Q12908 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SLC10A2Q12908 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SLC10A2Q12908 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SLC10A2Q12908 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
SLC10A2Q12908 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SLC10A2Q12908 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SLC10A2Q12908 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SLC10A2Q12908 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SLC10A2Q12908 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SLC10A2Q12908 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SLC10A2Q12908 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SLC10A2Q12908 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SLC10A2Q12908 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SLC10A2Q12908 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SLC10A2Q12908 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SLC10A2Q12908 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SLC10A2Q12908 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SLC10A2Q12908 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
SLC10A2Q12908 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
SLC10A2Q12908 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SLC10A2Q12908 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
SLC10A2Q12908 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SLC10A2Q12908 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SLC10A2Q12908 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SLC10A2Q12908 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SLC10A2Q12908 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SLC10A2Q12908 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SLC10A2Q12908 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SLC10A2Q12908 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SLC10A2Q12908 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SLC10A2Q12908 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SLC10A2Q12908 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SLC10A2Q12908 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SLC10A2Q12908 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SLC10A2Q12908 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SLC10A2Q12908 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SLC10A2Q12908 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SLC10A2Q12908 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SLC10A2Q12908 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SLC10A2Q12908 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SLC10A2Q12908 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SLC10A2Q12908 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SLC10A2Q12908 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SLC10A2Q12908 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SLC10A2Q12908 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SLC10A2Q12908 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
SLC10A2Q12908 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SLC10A2Q12908 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SLC10A2Q12908 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SLC10A2Q12908 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SLC10A2Q12908 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SLC10A2Q12908 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SLC10A2Q12908 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
SLC10A2Q12908 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC10A2Q12908 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC10A2Q12908 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC10A2Q12908 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC10A2Q12908 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC10A2Q12908 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms