Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

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Length 3,046 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
BPTFQ12830 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
BPTFQ12830 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
BPTFQ12830 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
BPTFQ12830 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
BPTFQ12830 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
BPTFQ12830 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
BPTFQ12830 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
BPTFQ12830 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
BPTFQ12830 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
BPTFQ12830 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
BPTFQ12830 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
BPTFQ12830 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
BPTFQ12830 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
BPTFQ12830 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
BPTFQ12830 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
BPTFQ12830 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
BPTFQ12830 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
BPTFQ12830 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
BPTFQ12830 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
BPTFQ12830 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
BPTFQ12830 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
BPTFQ12830 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
BPTFQ12830 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
BPTFQ12830 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
BPTFQ12830 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
BPTFQ12830 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
BPTFQ12830 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
BPTFQ12830 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
BPTFQ12830 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
BPTFQ12830 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
BPTFQ12830 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
BPTFQ12830 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
BPTFQ12830 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
BPTFQ12830 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
BPTFQ12830 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
BPTFQ12830 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
BPTFQ12830 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
BPTFQ12830 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
BPTFQ12830 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
BPTFQ12830 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
BPTFQ12830 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
BPTFQ12830 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
BPTFQ12830 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
BPTFQ12830 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
BPTFQ12830 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
BPTFQ12830 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
BPTFQ12830 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
BPTFQ12830 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC18.78■□□□□ 0.6
BPTFQ12830 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
BPTFQ12830 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
BPTFQ12830 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
BPTFQ12830 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
BPTFQ12830 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
BPTFQ12830 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
BPTFQ12830 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
BPTFQ12830 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
BPTFQ12830 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
BPTFQ12830 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
BPTFQ12830 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
BPTFQ12830 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
BPTFQ12830 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
BPTFQ12830 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
BPTFQ12830 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
BPTFQ12830 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
BPTFQ12830 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
BPTFQ12830 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
BPTFQ12830 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
BPTFQ12830 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
BPTFQ12830 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
BPTFQ12830 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
BPTFQ12830 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
BPTFQ12830 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
BPTFQ12830 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
BPTFQ12830 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
BPTFQ12830 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
BPTFQ12830 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
BPTFQ12830 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
BPTFQ12830 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
BPTFQ12830 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
BPTFQ12830 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
BPTFQ12830 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
BPTFQ12830 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
BPTFQ12830 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
BPTFQ12830 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
BPTFQ12830 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
BPTFQ12830 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
BPTFQ12830 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
BPTFQ12830 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
BPTFQ12830 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
BPTFQ12830 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
BPTFQ12830 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
BPTFQ12830 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
BPTFQ12830 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
BPTFQ12830 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
BPTFQ12830 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
BPTFQ12830 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
BPTFQ12830 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
BPTFQ12830 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
BPTFQ12830 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
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