Protein–RNA interactions for Protein: Q12778

FOXO1, Forkhead box protein O1, humanhuman

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Length 655 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO1Q12778 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FOXO1Q12778 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FOXO1Q12778 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FOXO1Q12778 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FOXO1Q12778 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FOXO1Q12778 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FOXO1Q12778 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FOXO1Q12778 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
FOXO1Q12778 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FOXO1Q12778 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FOXO1Q12778 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
FOXO1Q12778 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
FOXO1Q12778 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FOXO1Q12778 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FOXO1Q12778 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FOXO1Q12778 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC17■□□□□ 0.31
FOXO1Q12778 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
FOXO1Q12778 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
FOXO1Q12778 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC17■□□□□ 0.31
FOXO1Q12778 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
FOXO1Q12778 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
FOXO1Q12778 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
FOXO1Q12778 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC17■□□□□ 0.31
FOXO1Q12778 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FOXO1Q12778 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC17■□□□□ 0.31
FOXO1Q12778 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
FOXO1Q12778 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
FOXO1Q12778 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
FOXO1Q12778 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FOXO1Q12778 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FOXO1Q12778 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FOXO1Q12778 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FOXO1Q12778 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
FOXO1Q12778 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FOXO1Q12778 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FOXO1Q12778 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FOXO1Q12778 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FOXO1Q12778 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FOXO1Q12778 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FOXO1Q12778 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FOXO1Q12778 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FOXO1Q12778 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FOXO1Q12778 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
FOXO1Q12778 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FOXO1Q12778 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FOXO1Q12778 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FOXO1Q12778 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FOXO1Q12778 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FOXO1Q12778 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FOXO1Q12778 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FOXO1Q12778 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FOXO1Q12778 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
FOXO1Q12778 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FOXO1Q12778 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FOXO1Q12778 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FOXO1Q12778 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FOXO1Q12778 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FOXO1Q12778 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FOXO1Q12778 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FOXO1Q12778 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FOXO1Q12778 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FOXO1Q12778 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FOXO1Q12778 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
FOXO1Q12778 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FOXO1Q12778 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FOXO1Q12778 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FOXO1Q12778 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FOXO1Q12778 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FOXO1Q12778 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FOXO1Q12778 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FOXO1Q12778 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
FOXO1Q12778 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FOXO1Q12778 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FOXO1Q12778 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FOXO1Q12778 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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FOXO1Q12778 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FOXO1Q12778 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FOXO1Q12778 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FOXO1Q12778 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FOXO1Q12778 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FOXO1Q12778 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FOXO1Q12778 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FOXO1Q12778 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FOXO1Q12778 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FOXO1Q12778 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
FOXO1Q12778 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FOXO1Q12778 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FOXO1Q12778 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FOXO1Q12778 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FOXO1Q12778 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FOXO1Q12778 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FOXO1Q12778 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FOXO1Q12778 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
FOXO1Q12778 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FOXO1Q12778 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FOXO1Q12778 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FOXO1Q12778 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FOXO1Q12778 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FOXO1Q12778 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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