Protein–RNA interactions for Protein: Q0VD83

APOBR, Apolipoprotein B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,088 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBRQ0VD83 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
APOBRQ0VD83 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
APOBRQ0VD83 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
APOBRQ0VD83 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
APOBRQ0VD83 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
APOBRQ0VD83 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
APOBRQ0VD83 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
APOBRQ0VD83 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
APOBRQ0VD83 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
APOBRQ0VD83 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
APOBRQ0VD83 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
APOBRQ0VD83 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
APOBRQ0VD83 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
APOBRQ0VD83 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
APOBRQ0VD83 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
APOBRQ0VD83 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
APOBRQ0VD83 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
APOBRQ0VD83 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
APOBRQ0VD83 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
APOBRQ0VD83 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
APOBRQ0VD83 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
APOBRQ0VD83 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
APOBRQ0VD83 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
APOBRQ0VD83 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
APOBRQ0VD83 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
APOBRQ0VD83 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
APOBRQ0VD83 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
APOBRQ0VD83 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
APOBRQ0VD83 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
APOBRQ0VD83 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
APOBRQ0VD83 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
APOBRQ0VD83 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
APOBRQ0VD83 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
APOBRQ0VD83 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
APOBRQ0VD83 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
APOBRQ0VD83 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
APOBRQ0VD83 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
APOBRQ0VD83 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
APOBRQ0VD83 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
APOBRQ0VD83 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
APOBRQ0VD83 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
APOBRQ0VD83 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
APOBRQ0VD83 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
APOBRQ0VD83 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
APOBRQ0VD83 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
APOBRQ0VD83 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
APOBRQ0VD83 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
APOBRQ0VD83 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
APOBRQ0VD83 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
APOBRQ0VD83 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
APOBRQ0VD83 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
APOBRQ0VD83 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
APOBRQ0VD83 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
APOBRQ0VD83 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
APOBRQ0VD83 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
APOBRQ0VD83 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
APOBRQ0VD83 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
APOBRQ0VD83 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
APOBRQ0VD83 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
APOBRQ0VD83 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
APOBRQ0VD83 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
APOBRQ0VD83 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
APOBRQ0VD83 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
APOBRQ0VD83 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
APOBRQ0VD83 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC22■■□□□ 1.11
APOBRQ0VD83 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC22■■□□□ 1.11
APOBRQ0VD83 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
APOBRQ0VD83 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
APOBRQ0VD83 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
APOBRQ0VD83 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
APOBRQ0VD83 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
APOBRQ0VD83 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
APOBRQ0VD83 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
APOBRQ0VD83 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
APOBRQ0VD83 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
APOBRQ0VD83 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
APOBRQ0VD83 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
APOBRQ0VD83 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
APOBRQ0VD83 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
APOBRQ0VD83 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
APOBRQ0VD83 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
APOBRQ0VD83 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
APOBRQ0VD83 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
APOBRQ0VD83 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
APOBRQ0VD83 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
APOBRQ0VD83 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
APOBRQ0VD83 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
APOBRQ0VD83 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
APOBRQ0VD83 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
APOBRQ0VD83 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
APOBRQ0VD83 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
APOBRQ0VD83 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
APOBRQ0VD83 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
APOBRQ0VD83 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
APOBRQ0VD83 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
APOBRQ0VD83 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
APOBRQ0VD83 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
APOBRQ0VD83 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
APOBRQ0VD83 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
APOBRQ0VD83 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms