Protein–RNA interactions for Protein: Q08AF3

SLFN5, Schlafen family member 5, humanhuman

Predictions only

Length 891 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLFN5Q08AF3 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLFN5Q08AF3 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLFN5Q08AF3 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLFN5Q08AF3 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
SLFN5Q08AF3 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
SLFN5Q08AF3 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLFN5Q08AF3 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLFN5Q08AF3 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
SLFN5Q08AF3 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLFN5Q08AF3 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLFN5Q08AF3 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLFN5Q08AF3 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLFN5Q08AF3 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
SLFN5Q08AF3 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLFN5Q08AF3 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
SLFN5Q08AF3 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLFN5Q08AF3 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
SLFN5Q08AF3 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLFN5Q08AF3 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLFN5Q08AF3 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLFN5Q08AF3 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLFN5Q08AF3 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLFN5Q08AF3 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLFN5Q08AF3 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SLFN5Q08AF3 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
SLFN5Q08AF3 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
SLFN5Q08AF3 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SLFN5Q08AF3 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SLFN5Q08AF3 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SLFN5Q08AF3 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLFN5Q08AF3 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLFN5Q08AF3 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLFN5Q08AF3 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLFN5Q08AF3 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLFN5Q08AF3 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLFN5Q08AF3 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLFN5Q08AF3 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLFN5Q08AF3 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SLFN5Q08AF3 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLFN5Q08AF3 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLFN5Q08AF3 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLFN5Q08AF3 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLFN5Q08AF3 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLFN5Q08AF3 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLFN5Q08AF3 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLFN5Q08AF3 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLFN5Q08AF3 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLFN5Q08AF3 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLFN5Q08AF3 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLFN5Q08AF3 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLFN5Q08AF3 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLFN5Q08AF3 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLFN5Q08AF3 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLFN5Q08AF3 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLFN5Q08AF3 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLFN5Q08AF3 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLFN5Q08AF3 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLFN5Q08AF3 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SLFN5Q08AF3 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLFN5Q08AF3 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLFN5Q08AF3 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLFN5Q08AF3 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SLFN5Q08AF3 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLFN5Q08AF3 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLFN5Q08AF3 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLFN5Q08AF3 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLFN5Q08AF3 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLFN5Q08AF3 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLFN5Q08AF3 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLFN5Q08AF3 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLFN5Q08AF3 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLFN5Q08AF3 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLFN5Q08AF3 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLFN5Q08AF3 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLFN5Q08AF3 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLFN5Q08AF3 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLFN5Q08AF3 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLFN5Q08AF3 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLFN5Q08AF3 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SLFN5Q08AF3 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SLFN5Q08AF3 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLFN5Q08AF3 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLFN5Q08AF3 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLFN5Q08AF3 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLFN5Q08AF3 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLFN5Q08AF3 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLFN5Q08AF3 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLFN5Q08AF3 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLFN5Q08AF3 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLFN5Q08AF3 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLFN5Q08AF3 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLFN5Q08AF3 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLFN5Q08AF3 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLFN5Q08AF3 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLFN5Q08AF3 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SLFN5Q08AF3 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLFN5Q08AF3 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLFN5Q08AF3 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SLFN5Q08AF3 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLFN5Q08AF3 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms