Protein–RNA interactions for Protein: Q08708

CD300C, CMRF35-like molecule 6, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD300CQ08708 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CD300CQ08708 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CD300CQ08708 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CD300CQ08708 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CD300CQ08708 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CD300CQ08708 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CD300CQ08708 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CD300CQ08708 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CD300CQ08708 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CD300CQ08708 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CD300CQ08708 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CD300CQ08708 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CD300CQ08708 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CD300CQ08708 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD300CQ08708 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD300CQ08708 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD300CQ08708 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD300CQ08708 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD300CQ08708 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD300CQ08708 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD300CQ08708 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD300CQ08708 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD300CQ08708 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD300CQ08708 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD300CQ08708 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD300CQ08708 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD300CQ08708 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CD300CQ08708 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CD300CQ08708 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CD300CQ08708 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD300CQ08708 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD300CQ08708 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD300CQ08708 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD300CQ08708 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD300CQ08708 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD300CQ08708 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD300CQ08708 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD300CQ08708 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD300CQ08708 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD300CQ08708 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD300CQ08708 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD300CQ08708 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD300CQ08708 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD300CQ08708 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD300CQ08708 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD300CQ08708 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD300CQ08708 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD300CQ08708 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD300CQ08708 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD300CQ08708 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CD300CQ08708 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD300CQ08708 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD300CQ08708 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD300CQ08708 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD300CQ08708 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD300CQ08708 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD300CQ08708 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD300CQ08708 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD300CQ08708 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD300CQ08708 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD300CQ08708 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD300CQ08708 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD300CQ08708 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD300CQ08708 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD300CQ08708 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD300CQ08708 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD300CQ08708 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD300CQ08708 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD300CQ08708 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD300CQ08708 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD300CQ08708 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD300CQ08708 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD300CQ08708 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD300CQ08708 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD300CQ08708 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD300CQ08708 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD300CQ08708 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD300CQ08708 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD300CQ08708 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD300CQ08708 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD300CQ08708 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CD300CQ08708 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD300CQ08708 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CD300CQ08708 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD300CQ08708 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD300CQ08708 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD300CQ08708 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD300CQ08708 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD300CQ08708 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD300CQ08708 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD300CQ08708 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD300CQ08708 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD300CQ08708 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD300CQ08708 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD300CQ08708 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD300CQ08708 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD300CQ08708 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD300CQ08708 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD300CQ08708 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CD300CQ08708 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms