Protein–RNA interactions for Protein: Q05209

PTPN12, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN12Q05209 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPN12Q05209 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPN12Q05209 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPN12Q05209 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPN12Q05209 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPN12Q05209 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPN12Q05209 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPN12Q05209 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPN12Q05209 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPN12Q05209 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPN12Q05209 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPN12Q05209 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPN12Q05209 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPN12Q05209 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPN12Q05209 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPN12Q05209 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPN12Q05209 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPN12Q05209 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPN12Q05209 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPN12Q05209 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPN12Q05209 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPN12Q05209 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPN12Q05209 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPN12Q05209 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPN12Q05209 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPN12Q05209 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPN12Q05209 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPN12Q05209 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPN12Q05209 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPN12Q05209 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPN12Q05209 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPN12Q05209 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPN12Q05209 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPN12Q05209 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPN12Q05209 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPN12Q05209 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPN12Q05209 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPN12Q05209 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPN12Q05209 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPN12Q05209 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPN12Q05209 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPN12Q05209 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPN12Q05209 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPN12Q05209 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPN12Q05209 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPN12Q05209 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPN12Q05209 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPN12Q05209 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPN12Q05209 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPN12Q05209 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPN12Q05209 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTPN12Q05209 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTPN12Q05209 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTPN12Q05209 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTPN12Q05209 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
PTPN12Q05209 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTPN12Q05209 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTPN12Q05209 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTPN12Q05209 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTPN12Q05209 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
PTPN12Q05209 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTPN12Q05209 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTPN12Q05209 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTPN12Q05209 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
PTPN12Q05209 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTPN12Q05209 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTPN12Q05209 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTPN12Q05209 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTPN12Q05209 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTPN12Q05209 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTPN12Q05209 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTPN12Q05209 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTPN12Q05209 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTPN12Q05209 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTPN12Q05209 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTPN12Q05209 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTPN12Q05209 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTPN12Q05209 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTPN12Q05209 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTPN12Q05209 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTPN12Q05209 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
PTPN12Q05209 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTPN12Q05209 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTPN12Q05209 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
PTPN12Q05209 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTPN12Q05209 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTPN12Q05209 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
PTPN12Q05209 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTPN12Q05209 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTPN12Q05209 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTPN12Q05209 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTPN12Q05209 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PTPN12Q05209 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PTPN12Q05209 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
PTPN12Q05209 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTPN12Q05209 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTPN12Q05209 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTPN12Q05209 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTPN12Q05209 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTPN12Q05209 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms