Protein–RNA interactions for Protein: Q02742

GCNT1, Beta-1,3-galactosyl-O-glycosyl-glycoprotein beta-1,6-N-acetylglucosaminyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNT1Q02742 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GCNT1Q02742 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GCNT1Q02742 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
GCNT1Q02742 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GCNT1Q02742 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GCNT1Q02742 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GCNT1Q02742 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GCNT1Q02742 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GCNT1Q02742 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GCNT1Q02742 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GCNT1Q02742 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GCNT1Q02742 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
GCNT1Q02742 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GCNT1Q02742 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
GCNT1Q02742 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GCNT1Q02742 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GCNT1Q02742 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GCNT1Q02742 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GCNT1Q02742 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GCNT1Q02742 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GCNT1Q02742 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
GCNT1Q02742 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
GCNT1Q02742 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
GCNT1Q02742 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
GCNT1Q02742 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
GCNT1Q02742 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
GCNT1Q02742 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GCNT1Q02742 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GCNT1Q02742 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GCNT1Q02742 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GCNT1Q02742 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GCNT1Q02742 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GCNT1Q02742 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GCNT1Q02742 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GCNT1Q02742 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GCNT1Q02742 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GCNT1Q02742 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
GCNT1Q02742 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GCNT1Q02742 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GCNT1Q02742 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GCNT1Q02742 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GCNT1Q02742 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GCNT1Q02742 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GCNT1Q02742 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GCNT1Q02742 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GCNT1Q02742 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GCNT1Q02742 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
GCNT1Q02742 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GCNT1Q02742 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC20■□□□□ 0.79
GCNT1Q02742 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GCNT1Q02742 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GCNT1Q02742 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GCNT1Q02742 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GCNT1Q02742 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GCNT1Q02742 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GCNT1Q02742 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
GCNT1Q02742 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GCNT1Q02742 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GCNT1Q02742 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
GCNT1Q02742 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GCNT1Q02742 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GCNT1Q02742 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
GCNT1Q02742 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
GCNT1Q02742 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
GCNT1Q02742 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
GCNT1Q02742 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GCNT1Q02742 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC20■□□□□ 0.79
GCNT1Q02742 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
GCNT1Q02742 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC20■□□□□ 0.79
GCNT1Q02742 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GCNT1Q02742 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GCNT1Q02742 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
GCNT1Q02742 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
GCNT1Q02742 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
GCNT1Q02742 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GCNT1Q02742 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GCNT1Q02742 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GCNT1Q02742 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GCNT1Q02742 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GCNT1Q02742 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GCNT1Q02742 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GCNT1Q02742 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GCNT1Q02742 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GCNT1Q02742 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GCNT1Q02742 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GCNT1Q02742 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GCNT1Q02742 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GCNT1Q02742 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GCNT1Q02742 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GCNT1Q02742 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GCNT1Q02742 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GCNT1Q02742 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
GCNT1Q02742 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GCNT1Q02742 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GCNT1Q02742 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GCNT1Q02742 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GCNT1Q02742 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GCNT1Q02742 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GCNT1Q02742 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GCNT1Q02742 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms