Protein–RNA interactions for Protein: Q02487

DSC2, Desmocollin-2, humanhuman

Predictions only

Length 901 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC2Q02487 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
DSC2Q02487 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
DSC2Q02487 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
DSC2Q02487 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
DSC2Q02487 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
DSC2Q02487 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
DSC2Q02487 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
DSC2Q02487 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
DSC2Q02487 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
DSC2Q02487 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
DSC2Q02487 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
DSC2Q02487 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
DSC2Q02487 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
DSC2Q02487 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
DSC2Q02487 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
DSC2Q02487 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
DSC2Q02487 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
DSC2Q02487 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
DSC2Q02487 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
DSC2Q02487 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
DSC2Q02487 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
DSC2Q02487 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
DSC2Q02487 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
DSC2Q02487 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
DSC2Q02487 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
DSC2Q02487 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
DSC2Q02487 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
DSC2Q02487 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
DSC2Q02487 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
DSC2Q02487 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
DSC2Q02487 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
DSC2Q02487 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
DSC2Q02487 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
DSC2Q02487 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
DSC2Q02487 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
DSC2Q02487 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
DSC2Q02487 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
DSC2Q02487 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
DSC2Q02487 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
DSC2Q02487 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
DSC2Q02487 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
DSC2Q02487 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
DSC2Q02487 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
DSC2Q02487 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
DSC2Q02487 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
DSC2Q02487 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
DSC2Q02487 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
DSC2Q02487 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
DSC2Q02487 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
DSC2Q02487 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
DSC2Q02487 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
DSC2Q02487 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
DSC2Q02487 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
DSC2Q02487 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
DSC2Q02487 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
DSC2Q02487 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
DSC2Q02487 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
DSC2Q02487 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
DSC2Q02487 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
DSC2Q02487 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
DSC2Q02487 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
DSC2Q02487 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
DSC2Q02487 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
DSC2Q02487 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
DSC2Q02487 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
DSC2Q02487 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
DSC2Q02487 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
DSC2Q02487 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
DSC2Q02487 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
DSC2Q02487 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
DSC2Q02487 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
DSC2Q02487 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
DSC2Q02487 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
DSC2Q02487 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
DSC2Q02487 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
DSC2Q02487 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
DSC2Q02487 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
DSC2Q02487 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
DSC2Q02487 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
DSC2Q02487 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
DSC2Q02487 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
DSC2Q02487 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
DSC2Q02487 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
DSC2Q02487 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
DSC2Q02487 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
DSC2Q02487 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
DSC2Q02487 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
DSC2Q02487 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
DSC2Q02487 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
DSC2Q02487 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
DSC2Q02487 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
DSC2Q02487 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
DSC2Q02487 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
DSC2Q02487 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
DSC2Q02487 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
DSC2Q02487 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
DSC2Q02487 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
DSC2Q02487 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
DSC2Q02487 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
DSC2Q02487 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms