Protein–RNA interactions for Protein: Q01780

EXOSC10, Exosome component 10, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 885 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC10Q01780 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
EXOSC10Q01780 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
EXOSC10Q01780 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
EXOSC10Q01780 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
EXOSC10Q01780 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
EXOSC10Q01780 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
EXOSC10Q01780 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
EXOSC10Q01780 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
EXOSC10Q01780 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
EXOSC10Q01780 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
EXOSC10Q01780 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
EXOSC10Q01780 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
EXOSC10Q01780 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
EXOSC10Q01780 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
EXOSC10Q01780 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
EXOSC10Q01780 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
EXOSC10Q01780 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
EXOSC10Q01780 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
EXOSC10Q01780 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
EXOSC10Q01780 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
EXOSC10Q01780 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
EXOSC10Q01780 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
EXOSC10Q01780 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
EXOSC10Q01780 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
EXOSC10Q01780 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
EXOSC10Q01780 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
EXOSC10Q01780 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
EXOSC10Q01780 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
EXOSC10Q01780 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
EXOSC10Q01780 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
EXOSC10Q01780 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
EXOSC10Q01780 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
EXOSC10Q01780 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
EXOSC10Q01780 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
EXOSC10Q01780 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
EXOSC10Q01780 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
EXOSC10Q01780 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
EXOSC10Q01780 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
EXOSC10Q01780 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
EXOSC10Q01780 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC21.95■■□□□ 1.11
EXOSC10Q01780 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
EXOSC10Q01780 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
EXOSC10Q01780 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
EXOSC10Q01780 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
EXOSC10Q01780 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
EXOSC10Q01780 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
EXOSC10Q01780 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
EXOSC10Q01780 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
EXOSC10Q01780 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
EXOSC10Q01780 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
EXOSC10Q01780 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
EXOSC10Q01780 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
EXOSC10Q01780 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
EXOSC10Q01780 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
EXOSC10Q01780 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
EXOSC10Q01780 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
EXOSC10Q01780 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
EXOSC10Q01780 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
EXOSC10Q01780 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
EXOSC10Q01780 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
EXOSC10Q01780 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
EXOSC10Q01780 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
EXOSC10Q01780 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
EXOSC10Q01780 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
EXOSC10Q01780 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
EXOSC10Q01780 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
EXOSC10Q01780 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
EXOSC10Q01780 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
EXOSC10Q01780 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
EXOSC10Q01780 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
EXOSC10Q01780 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
EXOSC10Q01780 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
EXOSC10Q01780 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
EXOSC10Q01780 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
EXOSC10Q01780 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
EXOSC10Q01780 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
EXOSC10Q01780 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
EXOSC10Q01780 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
EXOSC10Q01780 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
EXOSC10Q01780 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
EXOSC10Q01780 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
EXOSC10Q01780 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
EXOSC10Q01780 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
EXOSC10Q01780 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
EXOSC10Q01780 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
EXOSC10Q01780 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
EXOSC10Q01780 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
EXOSC10Q01780 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
EXOSC10Q01780 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
EXOSC10Q01780 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
EXOSC10Q01780 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
EXOSC10Q01780 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
EXOSC10Q01780 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
EXOSC10Q01780 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
EXOSC10Q01780 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
EXOSC10Q01780 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
EXOSC10Q01780 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
EXOSC10Q01780 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
EXOSC10Q01780 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
EXOSC10Q01780 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms