Protein–RNA interactions for Protein: Q00987

MDM2, E3 ubiquitin-protein ligase Mdm2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDM2Q00987 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
MDM2Q00987 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MDM2Q00987 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
MDM2Q00987 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MDM2Q00987 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MDM2Q00987 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MDM2Q00987 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MDM2Q00987 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MDM2Q00987 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MDM2Q00987 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MDM2Q00987 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MDM2Q00987 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MDM2Q00987 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MDM2Q00987 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MDM2Q00987 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MDM2Q00987 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MDM2Q00987 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MDM2Q00987 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MDM2Q00987 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MDM2Q00987 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MDM2Q00987 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MDM2Q00987 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MDM2Q00987 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MDM2Q00987 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MDM2Q00987 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MDM2Q00987 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MDM2Q00987 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MDM2Q00987 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MDM2Q00987 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
MDM2Q00987 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MDM2Q00987 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
MDM2Q00987 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MDM2Q00987 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MDM2Q00987 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MDM2Q00987 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MDM2Q00987 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MDM2Q00987 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MDM2Q00987 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MDM2Q00987 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MDM2Q00987 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MDM2Q00987 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MDM2Q00987 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
MDM2Q00987 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MDM2Q00987 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MDM2Q00987 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MDM2Q00987 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MDM2Q00987 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MDM2Q00987 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MDM2Q00987 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MDM2Q00987 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MDM2Q00987 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MDM2Q00987 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MDM2Q00987 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
MDM2Q00987 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MDM2Q00987 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MDM2Q00987 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MDM2Q00987 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MDM2Q00987 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MDM2Q00987 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MDM2Q00987 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MDM2Q00987 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MDM2Q00987 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MDM2Q00987 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MDM2Q00987 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MDM2Q00987 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MDM2Q00987 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MDM2Q00987 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MDM2Q00987 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MDM2Q00987 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MDM2Q00987 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MDM2Q00987 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MDM2Q00987 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MDM2Q00987 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MDM2Q00987 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MDM2Q00987 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MDM2Q00987 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MDM2Q00987 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MDM2Q00987 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MDM2Q00987 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
MDM2Q00987 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MDM2Q00987 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
MDM2Q00987 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
MDM2Q00987 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MDM2Q00987 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MDM2Q00987 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MDM2Q00987 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MDM2Q00987 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MDM2Q00987 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MDM2Q00987 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MDM2Q00987 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MDM2Q00987 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MDM2Q00987 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MDM2Q00987 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MDM2Q00987 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
MDM2Q00987 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
MDM2Q00987 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MDM2Q00987 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
MDM2Q00987 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
MDM2Q00987 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
MDM2Q00987 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms