Protein–RNA interactions for Protein: P80075

CCL8, C-C motif chemokine 8, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL8P80075 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCL8P80075 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCL8P80075 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCL8P80075 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCL8P80075 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CCL8P80075 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCL8P80075 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCL8P80075 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCL8P80075 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCL8P80075 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCL8P80075 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCL8P80075 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCL8P80075 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCL8P80075 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCL8P80075 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCL8P80075 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCL8P80075 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCL8P80075 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCL8P80075 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCL8P80075 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCL8P80075 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCL8P80075 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCL8P80075 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCL8P80075 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCL8P80075 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCL8P80075 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCL8P80075 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCL8P80075 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCL8P80075 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCL8P80075 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCL8P80075 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCL8P80075 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCL8P80075 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCL8P80075 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCL8P80075 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCL8P80075 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CCL8P80075 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CCL8P80075 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCL8P80075 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CCL8P80075 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCL8P80075 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CCL8P80075 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCL8P80075 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCL8P80075 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCL8P80075 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCL8P80075 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCL8P80075 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCL8P80075 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCL8P80075 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCL8P80075 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCL8P80075 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCL8P80075 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCL8P80075 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCL8P80075 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCL8P80075 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCL8P80075 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCL8P80075 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CCL8P80075 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCL8P80075 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCL8P80075 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCL8P80075 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCL8P80075 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCL8P80075 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCL8P80075 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCL8P80075 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCL8P80075 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCL8P80075 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCL8P80075 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCL8P80075 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCL8P80075 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCL8P80075 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCL8P80075 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCL8P80075 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCL8P80075 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCL8P80075 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCL8P80075 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCL8P80075 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCL8P80075 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCL8P80075 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CCL8P80075 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCL8P80075 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCL8P80075 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCL8P80075 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCL8P80075 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCL8P80075 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCL8P80075 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCL8P80075 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCL8P80075 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCL8P80075 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCL8P80075 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCL8P80075 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCL8P80075 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCL8P80075 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCL8P80075 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCL8P80075 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCL8P80075 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCL8P80075 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCL8P80075 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCL8P80075 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCL8P80075 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms