Protein–RNA interactions for Protein: P68133

ACTA1, Actin, alpha skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTA1P68133 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ACTA1P68133 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ACTA1P68133 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ACTA1P68133 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ACTA1P68133 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ACTA1P68133 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ACTA1P68133 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ACTA1P68133 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ACTA1P68133 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ACTA1P68133 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ACTA1P68133 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ACTA1P68133 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ACTA1P68133 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ACTA1P68133 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ACTA1P68133 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
ACTA1P68133 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
ACTA1P68133 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ACTA1P68133 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ACTA1P68133 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ACTA1P68133 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ACTA1P68133 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ACTA1P68133 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ACTA1P68133 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ACTA1P68133 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ACTA1P68133 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ACTA1P68133 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ACTA1P68133 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ACTA1P68133 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ACTA1P68133 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ACTA1P68133 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ACTA1P68133 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ACTA1P68133 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ACTA1P68133 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ACTA1P68133 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ACTA1P68133 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ACTA1P68133 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ACTA1P68133 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ACTA1P68133 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ACTA1P68133 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ACTA1P68133 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ACTA1P68133 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ACTA1P68133 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ACTA1P68133 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ACTA1P68133 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ACTA1P68133 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ACTA1P68133 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ACTA1P68133 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
ACTA1P68133 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ACTA1P68133 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
ACTA1P68133 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ACTA1P68133 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ACTA1P68133 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ACTA1P68133 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ACTA1P68133 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ACTA1P68133 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ACTA1P68133 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ACTA1P68133 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ACTA1P68133 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ACTA1P68133 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ACTA1P68133 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ACTA1P68133 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ACTA1P68133 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ACTA1P68133 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ACTA1P68133 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ACTA1P68133 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ACTA1P68133 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ACTA1P68133 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ACTA1P68133 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ACTA1P68133 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ACTA1P68133 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ACTA1P68133 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ACTA1P68133 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ACTA1P68133 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ACTA1P68133 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ACTA1P68133 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ACTA1P68133 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ACTA1P68133 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ACTA1P68133 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ACTA1P68133 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ACTA1P68133 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ACTA1P68133 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ACTA1P68133 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ACTA1P68133 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ACTA1P68133 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ACTA1P68133 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
ACTA1P68133 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
ACTA1P68133 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
ACTA1P68133 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
ACTA1P68133 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
ACTA1P68133 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACTA1P68133 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ACTA1P68133 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACTA1P68133 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACTA1P68133 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACTA1P68133 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACTA1P68133 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACTA1P68133 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACTA1P68133 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACTA1P68133 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACTA1P68133 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms