Protein–RNA interactions for Protein: P63132

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pol protein, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63132 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HERVK_113P63132 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HERVK_113P63132 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HERVK_113P63132 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HERVK_113P63132 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HERVK_113P63132 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HERVK_113P63132 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
HERVK_113P63132 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HERVK_113P63132 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HERVK_113P63132 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HERVK_113P63132 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HERVK_113P63132 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HERVK_113P63132 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HERVK_113P63132 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HERVK_113P63132 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HERVK_113P63132 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HERVK_113P63132 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HERVK_113P63132 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HERVK_113P63132 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HERVK_113P63132 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
HERVK_113P63132 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HERVK_113P63132 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HERVK_113P63132 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
HERVK_113P63132 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HERVK_113P63132 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HERVK_113P63132 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HERVK_113P63132 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HERVK_113P63132 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
HERVK_113P63132 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
HERVK_113P63132 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
HERVK_113P63132 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
HERVK_113P63132 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
HERVK_113P63132 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
HERVK_113P63132 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
HERVK_113P63132 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
HERVK_113P63132 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
HERVK_113P63132 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.53
HERVK_113P63132 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
HERVK_113P63132 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
HERVK_113P63132 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HERVK_113P63132 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HERVK_113P63132 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HERVK_113P63132 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HERVK_113P63132 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HERVK_113P63132 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HERVK_113P63132 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HERVK_113P63132 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HERVK_113P63132 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
HERVK_113P63132 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HERVK_113P63132 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HERVK_113P63132 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HERVK_113P63132 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HERVK_113P63132 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HERVK_113P63132 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HERVK_113P63132 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HERVK_113P63132 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HERVK_113P63132 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HERVK_113P63132 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HERVK_113P63132 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HERVK_113P63132 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HERVK_113P63132 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HERVK_113P63132 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HERVK_113P63132 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HERVK_113P63132 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HERVK_113P63132 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HERVK_113P63132 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HERVK_113P63132 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
HERVK_113P63132 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
HERVK_113P63132 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
HERVK_113P63132 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
HERVK_113P63132 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HERVK_113P63132 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HERVK_113P63132 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HERVK_113P63132 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HERVK_113P63132 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HERVK_113P63132 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HERVK_113P63132 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
HERVK_113P63132 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
HERVK_113P63132 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HERVK_113P63132 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HERVK_113P63132 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HERVK_113P63132 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HERVK_113P63132 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HERVK_113P63132 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HERVK_113P63132 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HERVK_113P63132 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HERVK_113P63132 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
HERVK_113P63132 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HERVK_113P63132 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HERVK_113P63132 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HERVK_113P63132 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HERVK_113P63132 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HERVK_113P63132 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HERVK_113P63132 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HERVK_113P63132 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HERVK_113P63132 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HERVK_113P63132 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HERVK_113P63132 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HERVK_113P63132 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HERVK_113P63132 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms