Protein–RNA interactions for Protein: P62736

ACTA2, Actin, aortic smooth muscle, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTA2P62736 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACTA2P62736 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACTA2P62736 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACTA2P62736 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACTA2P62736 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACTA2P62736 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACTA2P62736 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACTA2P62736 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACTA2P62736 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACTA2P62736 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACTA2P62736 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACTA2P62736 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACTA2P62736 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
ACTA2P62736 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACTA2P62736 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACTA2P62736 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACTA2P62736 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACTA2P62736 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACTA2P62736 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACTA2P62736 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACTA2P62736 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
ACTA2P62736 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACTA2P62736 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACTA2P62736 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACTA2P62736 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACTA2P62736 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACTA2P62736 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACTA2P62736 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACTA2P62736 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACTA2P62736 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACTA2P62736 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACTA2P62736 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACTA2P62736 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACTA2P62736 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACTA2P62736 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACTA2P62736 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACTA2P62736 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACTA2P62736 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACTA2P62736 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACTA2P62736 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ACTA2P62736 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ACTA2P62736 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ACTA2P62736 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ACTA2P62736 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ACTA2P62736 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ACTA2P62736 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ACTA2P62736 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ACTA2P62736 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ACTA2P62736 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ACTA2P62736 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ACTA2P62736 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ACTA2P62736 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ACTA2P62736 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ACTA2P62736 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ACTA2P62736 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ACTA2P62736 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ACTA2P62736 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ACTA2P62736 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ACTA2P62736 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ACTA2P62736 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ACTA2P62736 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
ACTA2P62736 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
ACTA2P62736 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ACTA2P62736 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
ACTA2P62736 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
ACTA2P62736 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ACTA2P62736 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ACTA2P62736 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ACTA2P62736 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ACTA2P62736 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ACTA2P62736 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ACTA2P62736 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ACTA2P62736 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ACTA2P62736 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ACTA2P62736 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ACTA2P62736 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ACTA2P62736 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ACTA2P62736 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ACTA2P62736 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ACTA2P62736 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ACTA2P62736 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ACTA2P62736 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ACTA2P62736 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ACTA2P62736 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ACTA2P62736 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ACTA2P62736 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ACTA2P62736 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ACTA2P62736 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ACTA2P62736 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ACTA2P62736 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
ACTA2P62736 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ACTA2P62736 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ACTA2P62736 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ACTA2P62736 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ACTA2P62736 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ACTA2P62736 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ACTA2P62736 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ACTA2P62736 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ACTA2P62736 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ACTA2P62736 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms