Protein–RNA interactions for Protein: P61018

RAB4B, Ras-related protein Rab-4B, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB4BP61018 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB4BP61018 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB4BP61018 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB4BP61018 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB4BP61018 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB4BP61018 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB4BP61018 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB4BP61018 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB4BP61018 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB4BP61018 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB4BP61018 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB4BP61018 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB4BP61018 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB4BP61018 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB4BP61018 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB4BP61018 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB4BP61018 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB4BP61018 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB4BP61018 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB4BP61018 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB4BP61018 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB4BP61018 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB4BP61018 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB4BP61018 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB4BP61018 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB4BP61018 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB4BP61018 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB4BP61018 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB4BP61018 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB4BP61018 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB4BP61018 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB4BP61018 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB4BP61018 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB4BP61018 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB4BP61018 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB4BP61018 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB4BP61018 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB4BP61018 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB4BP61018 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB4BP61018 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB4BP61018 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB4BP61018 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB4BP61018 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB4BP61018 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB4BP61018 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB4BP61018 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB4BP61018 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB4BP61018 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB4BP61018 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB4BP61018 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB4BP61018 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB4BP61018 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB4BP61018 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB4BP61018 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB4BP61018 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB4BP61018 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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RAB4BP61018 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
RAB4BP61018 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
RAB4BP61018 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
RAB4BP61018 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
RAB4BP61018 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
RAB4BP61018 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
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RAB4BP61018 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RAB4BP61018 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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RAB4BP61018 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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RAB4BP61018 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RAB4BP61018 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
RAB4BP61018 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RAB4BP61018 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RAB4BP61018 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RAB4BP61018 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RAB4BP61018 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RAB4BP61018 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RAB4BP61018 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RAB4BP61018 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
RAB4BP61018 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RAB4BP61018 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RAB4BP61018 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RAB4BP61018 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RAB4BP61018 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RAB4BP61018 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RAB4BP61018 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RAB4BP61018 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RAB4BP61018 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RAB4BP61018 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RAB4BP61018 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RAB4BP61018 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RAB4BP61018 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RAB4BP61018 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RAB4BP61018 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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