Protein–RNA interactions for Protein: P60510

PPP4C, Serine/threonine-protein phosphatase 4 catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP4CP60510 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PPP4CP60510 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PPP4CP60510 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PPP4CP60510 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PPP4CP60510 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PPP4CP60510 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PPP4CP60510 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PPP4CP60510 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PPP4CP60510 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PPP4CP60510 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PPP4CP60510 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PPP4CP60510 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PPP4CP60510 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PPP4CP60510 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PPP4CP60510 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PPP4CP60510 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PPP4CP60510 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PPP4CP60510 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PPP4CP60510 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PPP4CP60510 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PPP4CP60510 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PPP4CP60510 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PPP4CP60510 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PPP4CP60510 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PPP4CP60510 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PPP4CP60510 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PPP4CP60510 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PPP4CP60510 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PPP4CP60510 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PPP4CP60510 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PPP4CP60510 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PPP4CP60510 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PPP4CP60510 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PPP4CP60510 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PPP4CP60510 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PPP4CP60510 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PPP4CP60510 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PPP4CP60510 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PPP4CP60510 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PPP4CP60510 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PPP4CP60510 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PPP4CP60510 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PPP4CP60510 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PPP4CP60510 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PPP4CP60510 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PPP4CP60510 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PPP4CP60510 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PPP4CP60510 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PPP4CP60510 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PPP4CP60510 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PPP4CP60510 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PPP4CP60510 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PPP4CP60510 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PPP4CP60510 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PPP4CP60510 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PPP4CP60510 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PPP4CP60510 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PPP4CP60510 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PPP4CP60510 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PPP4CP60510 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PPP4CP60510 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PPP4CP60510 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PPP4CP60510 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PPP4CP60510 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PPP4CP60510 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PPP4CP60510 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PPP4CP60510 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PPP4CP60510 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PPP4CP60510 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PPP4CP60510 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PPP4CP60510 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PPP4CP60510 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PPP4CP60510 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PPP4CP60510 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PPP4CP60510 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PPP4CP60510 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PPP4CP60510 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PPP4CP60510 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PPP4CP60510 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PPP4CP60510 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PPP4CP60510 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PPP4CP60510 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PPP4CP60510 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PPP4CP60510 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PPP4CP60510 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PPP4CP60510 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PPP4CP60510 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PPP4CP60510 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PPP4CP60510 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PPP4CP60510 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PPP4CP60510 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PPP4CP60510 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PPP4CP60510 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PPP4CP60510 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PPP4CP60510 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PPP4CP60510 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PPP4CP60510 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PPP4CP60510 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PPP4CP60510 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PPP4CP60510 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms