Protein–RNA interactions for Protein: P54646

PRKAA2, 5'-AMP-activated protein kinase catalytic subunit alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAA2P54646 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRKAA2P54646 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRKAA2P54646 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRKAA2P54646 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRKAA2P54646 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRKAA2P54646 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRKAA2P54646 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRKAA2P54646 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRKAA2P54646 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRKAA2P54646 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRKAA2P54646 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRKAA2P54646 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRKAA2P54646 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PRKAA2P54646 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRKAA2P54646 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRKAA2P54646 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRKAA2P54646 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRKAA2P54646 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRKAA2P54646 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRKAA2P54646 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRKAA2P54646 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRKAA2P54646 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PRKAA2P54646 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PRKAA2P54646 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRKAA2P54646 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PRKAA2P54646 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRKAA2P54646 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PRKAA2P54646 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRKAA2P54646 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRKAA2P54646 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRKAA2P54646 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRKAA2P54646 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PRKAA2P54646 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRKAA2P54646 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PRKAA2P54646 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PRKAA2P54646 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRKAA2P54646 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRKAA2P54646 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRKAA2P54646 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRKAA2P54646 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRKAA2P54646 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRKAA2P54646 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRKAA2P54646 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRKAA2P54646 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRKAA2P54646 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRKAA2P54646 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PRKAA2P54646 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRKAA2P54646 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRKAA2P54646 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRKAA2P54646 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRKAA2P54646 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PRKAA2P54646 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PRKAA2P54646 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRKAA2P54646 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRKAA2P54646 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRKAA2P54646 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRKAA2P54646 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRKAA2P54646 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRKAA2P54646 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRKAA2P54646 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRKAA2P54646 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRKAA2P54646 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRKAA2P54646 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRKAA2P54646 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRKAA2P54646 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRKAA2P54646 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRKAA2P54646 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRKAA2P54646 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRKAA2P54646 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRKAA2P54646 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PRKAA2P54646 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRKAA2P54646 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRKAA2P54646 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRKAA2P54646 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRKAA2P54646 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRKAA2P54646 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRKAA2P54646 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRKAA2P54646 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PRKAA2P54646 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRKAA2P54646 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRKAA2P54646 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRKAA2P54646 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC18.46■□□□□ 0.54
PRKAA2P54646 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRKAA2P54646 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRKAA2P54646 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRKAA2P54646 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRKAA2P54646 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRKAA2P54646 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRKAA2P54646 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRKAA2P54646 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRKAA2P54646 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRKAA2P54646 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRKAA2P54646 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRKAA2P54646 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PRKAA2P54646 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRKAA2P54646 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRKAA2P54646 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRKAA2P54646 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRKAA2P54646 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PRKAA2P54646 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms