Protein–RNA interactions for Protein: P53365

ARFIP2, Arfaptin-2, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFIP2P53365 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ARFIP2P53365 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ARFIP2P53365 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ARFIP2P53365 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
ARFIP2P53365 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
ARFIP2P53365 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
ARFIP2P53365 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ARFIP2P53365 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ARFIP2P53365 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ARFIP2P53365 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
ARFIP2P53365 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ARFIP2P53365 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ARFIP2P53365 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ARFIP2P53365 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ARFIP2P53365 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
ARFIP2P53365 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
ARFIP2P53365 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
ARFIP2P53365 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
ARFIP2P53365 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ARFIP2P53365 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ARFIP2P53365 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ARFIP2P53365 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ARFIP2P53365 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ARFIP2P53365 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ARFIP2P53365 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ARFIP2P53365 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ARFIP2P53365 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ARFIP2P53365 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ARFIP2P53365 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ARFIP2P53365 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ARFIP2P53365 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ARFIP2P53365 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ARFIP2P53365 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ARFIP2P53365 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ARFIP2P53365 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ARFIP2P53365 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ARFIP2P53365 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ARFIP2P53365 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ARFIP2P53365 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ARFIP2P53365 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ARFIP2P53365 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ARFIP2P53365 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ARFIP2P53365 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ARFIP2P53365 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ARFIP2P53365 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ARFIP2P53365 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ARFIP2P53365 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ARFIP2P53365 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ARFIP2P53365 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ARFIP2P53365 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ARFIP2P53365 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ARFIP2P53365 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ARFIP2P53365 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ARFIP2P53365 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ARFIP2P53365 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ARFIP2P53365 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ARFIP2P53365 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ARFIP2P53365 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ARFIP2P53365 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ARFIP2P53365 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ARFIP2P53365 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ARFIP2P53365 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ARFIP2P53365 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ARFIP2P53365 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ARFIP2P53365 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ARFIP2P53365 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ARFIP2P53365 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ARFIP2P53365 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ARFIP2P53365 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ARFIP2P53365 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ARFIP2P53365 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ARFIP2P53365 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ARFIP2P53365 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ARFIP2P53365 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ARFIP2P53365 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ARFIP2P53365 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARFIP2P53365 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARFIP2P53365 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARFIP2P53365 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARFIP2P53365 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARFIP2P53365 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARFIP2P53365 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARFIP2P53365 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARFIP2P53365 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARFIP2P53365 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARFIP2P53365 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARFIP2P53365 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARFIP2P53365 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARFIP2P53365 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARFIP2P53365 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARFIP2P53365 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ARFIP2P53365 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ARFIP2P53365 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ARFIP2P53365 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARFIP2P53365 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARFIP2P53365 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARFIP2P53365 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARFIP2P53365 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARFIP2P53365 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ARFIP2P53365 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms