Protein–RNA interactions for Protein: P51449

RORC, Nuclear receptor ROR-gamma, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RORCP51449 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RORCP51449 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RORCP51449 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RORCP51449 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RORCP51449 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RORCP51449 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
RORCP51449 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
RORCP51449 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
RORCP51449 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RORCP51449 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RORCP51449 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RORCP51449 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RORCP51449 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
RORCP51449 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RORCP51449 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
RORCP51449 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
RORCP51449 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RORCP51449 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RORCP51449 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RORCP51449 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RORCP51449 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
RORCP51449 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RORCP51449 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RORCP51449 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RORCP51449 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RORCP51449 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RORCP51449 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RORCP51449 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RORCP51449 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RORCP51449 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RORCP51449 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RORCP51449 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RORCP51449 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RORCP51449 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RORCP51449 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RORCP51449 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RORCP51449 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RORCP51449 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RORCP51449 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RORCP51449 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RORCP51449 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RORCP51449 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RORCP51449 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RORCP51449 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RORCP51449 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RORCP51449 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RORCP51449 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RORCP51449 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RORCP51449 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RORCP51449 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RORCP51449 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RORCP51449 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RORCP51449 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RORCP51449 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RORCP51449 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RORCP51449 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RORCP51449 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RORCP51449 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RORCP51449 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RORCP51449 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RORCP51449 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RORCP51449 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RORCP51449 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RORCP51449 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RORCP51449 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RORCP51449 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RORCP51449 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
RORCP51449 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
RORCP51449 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RORCP51449 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RORCP51449 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RORCP51449 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RORCP51449 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RORCP51449 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RORCP51449 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RORCP51449 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RORCP51449 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RORCP51449 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RORCP51449 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RORCP51449 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RORCP51449 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RORCP51449 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RORCP51449 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RORCP51449 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RORCP51449 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RORCP51449 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RORCP51449 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RORCP51449 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RORCP51449 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RORCP51449 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RORCP51449 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RORCP51449 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RORCP51449 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RORCP51449 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
RORCP51449 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RORCP51449 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RORCP51449 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RORCP51449 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RORCP51449 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RORCP51449 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.2 ms