Protein–RNA interactions for Protein: P51148

RAB5C, Ras-related protein Rab-5C, humanhuman

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB5CP51148 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB5CP51148 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB5CP51148 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB5CP51148 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB5CP51148 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB5CP51148 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB5CP51148 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB5CP51148 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB5CP51148 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB5CP51148 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB5CP51148 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB5CP51148 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB5CP51148 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB5CP51148 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB5CP51148 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB5CP51148 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB5CP51148 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB5CP51148 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB5CP51148 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB5CP51148 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB5CP51148 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB5CP51148 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB5CP51148 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB5CP51148 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB5CP51148 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB5CP51148 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB5CP51148 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB5CP51148 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB5CP51148 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB5CP51148 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB5CP51148 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB5CP51148 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB5CP51148 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB5CP51148 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB5CP51148 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB5CP51148 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB5CP51148 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB5CP51148 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB5CP51148 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB5CP51148 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB5CP51148 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RAB5CP51148 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
RAB5CP51148 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RAB5CP51148 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
RAB5CP51148 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RAB5CP51148 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RAB5CP51148 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
RAB5CP51148 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RAB5CP51148 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAB5CP51148 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RAB5CP51148 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAB5CP51148 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAB5CP51148 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAB5CP51148 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RAB5CP51148 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RAB5CP51148 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAB5CP51148 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RAB5CP51148 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAB5CP51148 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAB5CP51148 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RAB5CP51148 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RAB5CP51148 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RAB5CP51148 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAB5CP51148 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAB5CP51148 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAB5CP51148 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RAB5CP51148 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RAB5CP51148 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RAB5CP51148 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RAB5CP51148 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RAB5CP51148 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAB5CP51148 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RAB5CP51148 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAB5CP51148 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RAB5CP51148 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAB5CP51148 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RAB5CP51148 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RAB5CP51148 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAB5CP51148 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RAB5CP51148 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAB5CP51148 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAB5CP51148 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAB5CP51148 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAB5CP51148 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAB5CP51148 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAB5CP51148 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAB5CP51148 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAB5CP51148 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAB5CP51148 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RAB5CP51148 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAB5CP51148 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RAB5CP51148 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAB5CP51148 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RAB5CP51148 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RAB5CP51148 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAB5CP51148 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
RAB5CP51148 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAB5CP51148 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAB5CP51148 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RAB5CP51148 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms