Protein–RNA interactions for Protein: P50548

ERF, ETS domain-containing transcription factor ERF, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERFP50548 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERFP50548 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERFP50548 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
ERFP50548 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERFP50548 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERFP50548 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERFP50548 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERFP50548 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERFP50548 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERFP50548 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERFP50548 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERFP50548 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERFP50548 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERFP50548 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERFP50548 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERFP50548 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERFP50548 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERFP50548 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERFP50548 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERFP50548 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERFP50548 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERFP50548 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERFP50548 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERFP50548 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERFP50548 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERFP50548 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERFP50548 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERFP50548 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERFP50548 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERFP50548 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERFP50548 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
ERFP50548 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERFP50548 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERFP50548 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERFP50548 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERFP50548 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERFP50548 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERFP50548 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERFP50548 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERFP50548 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERFP50548 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERFP50548 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERFP50548 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERFP50548 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERFP50548 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERFP50548 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERFP50548 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERFP50548 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERFP50548 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERFP50548 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERFP50548 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERFP50548 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERFP50548 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERFP50548 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERFP50548 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERFP50548 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERFP50548 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERFP50548 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERFP50548 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERFP50548 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERFP50548 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERFP50548 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERFP50548 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERFP50548 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERFP50548 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERFP50548 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERFP50548 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERFP50548 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERFP50548 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERFP50548 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERFP50548 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERFP50548 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERFP50548 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERFP50548 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERFP50548 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERFP50548 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ERFP50548 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ERFP50548 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ERFP50548 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ERFP50548 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ERFP50548 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ERFP50548 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ERFP50548 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ERFP50548 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ERFP50548 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ERFP50548 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ERFP50548 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ERFP50548 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ERFP50548 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ERFP50548 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ERFP50548 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ERFP50548 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ERFP50548 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ERFP50548 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ERFP50548 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ERFP50548 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ERFP50548 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ERFP50548 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ERFP50548 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ERFP50548 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms