Protein–RNA interactions for Protein: P40198

CEACAM3, Carcinoembryonic antigen-related cell adhesion molecule 3, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEACAM3P40198 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CEACAM3P40198 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CEACAM3P40198 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CEACAM3P40198 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CEACAM3P40198 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CEACAM3P40198 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CEACAM3P40198 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CEACAM3P40198 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CEACAM3P40198 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CEACAM3P40198 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CEACAM3P40198 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CEACAM3P40198 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CEACAM3P40198 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CEACAM3P40198 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CEACAM3P40198 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CEACAM3P40198 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CEACAM3P40198 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CEACAM3P40198 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CEACAM3P40198 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CEACAM3P40198 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CEACAM3P40198 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CEACAM3P40198 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CEACAM3P40198 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CEACAM3P40198 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CEACAM3P40198 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CEACAM3P40198 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CEACAM3P40198 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CEACAM3P40198 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CEACAM3P40198 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CEACAM3P40198 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CEACAM3P40198 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CEACAM3P40198 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CEACAM3P40198 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CEACAM3P40198 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CEACAM3P40198 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CEACAM3P40198 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CEACAM3P40198 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CEACAM3P40198 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CEACAM3P40198 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CEACAM3P40198 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CEACAM3P40198 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CEACAM3P40198 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CEACAM3P40198 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CEACAM3P40198 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CEACAM3P40198 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CEACAM3P40198 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CEACAM3P40198 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CEACAM3P40198 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CEACAM3P40198 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CEACAM3P40198 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CEACAM3P40198 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CEACAM3P40198 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CEACAM3P40198 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CEACAM3P40198 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CEACAM3P40198 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CEACAM3P40198 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CEACAM3P40198 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CEACAM3P40198 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CEACAM3P40198 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CEACAM3P40198 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CEACAM3P40198 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CEACAM3P40198 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CEACAM3P40198 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CEACAM3P40198 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CEACAM3P40198 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CEACAM3P40198 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CEACAM3P40198 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CEACAM3P40198 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CEACAM3P40198 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CEACAM3P40198 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CEACAM3P40198 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CEACAM3P40198 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CEACAM3P40198 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CEACAM3P40198 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CEACAM3P40198 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CEACAM3P40198 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CEACAM3P40198 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CEACAM3P40198 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CEACAM3P40198 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CEACAM3P40198 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CEACAM3P40198 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CEACAM3P40198 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CEACAM3P40198 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CEACAM3P40198 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CEACAM3P40198 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CEACAM3P40198 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CEACAM3P40198 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CEACAM3P40198 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CEACAM3P40198 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CEACAM3P40198 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CEACAM3P40198 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CEACAM3P40198 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CEACAM3P40198 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CEACAM3P40198 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CEACAM3P40198 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CEACAM3P40198 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CEACAM3P40198 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CEACAM3P40198 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CEACAM3P40198 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CEACAM3P40198 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.7 ms