Protein–RNA interactions for Protein: P31415

CASQ1, Calsequestrin-1, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1P31415 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CASQ1P31415 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CASQ1P31415 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CASQ1P31415 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CASQ1P31415 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CASQ1P31415 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CASQ1P31415 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CASQ1P31415 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CASQ1P31415 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CASQ1P31415 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CASQ1P31415 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CASQ1P31415 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CASQ1P31415 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CASQ1P31415 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CASQ1P31415 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CASQ1P31415 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CASQ1P31415 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CASQ1P31415 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CASQ1P31415 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CASQ1P31415 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CASQ1P31415 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CASQ1P31415 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CASQ1P31415 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CASQ1P31415 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CASQ1P31415 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CASQ1P31415 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CASQ1P31415 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CASQ1P31415 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CASQ1P31415 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CASQ1P31415 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CASQ1P31415 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CASQ1P31415 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CASQ1P31415 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CASQ1P31415 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CASQ1P31415 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CASQ1P31415 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CASQ1P31415 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CASQ1P31415 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CASQ1P31415 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CASQ1P31415 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CASQ1P31415 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CASQ1P31415 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CASQ1P31415 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CASQ1P31415 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CASQ1P31415 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CASQ1P31415 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CASQ1P31415 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CASQ1P31415 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CASQ1P31415 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CASQ1P31415 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CASQ1P31415 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CASQ1P31415 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CASQ1P31415 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CASQ1P31415 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CASQ1P31415 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CASQ1P31415 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CASQ1P31415 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CASQ1P31415 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CASQ1P31415 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CASQ1P31415 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CASQ1P31415 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CASQ1P31415 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CASQ1P31415 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CASQ1P31415 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CASQ1P31415 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CASQ1P31415 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CASQ1P31415 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CASQ1P31415 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CASQ1P31415 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CASQ1P31415 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CASQ1P31415 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CASQ1P31415 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CASQ1P31415 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CASQ1P31415 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CASQ1P31415 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CASQ1P31415 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CASQ1P31415 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CASQ1P31415 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CASQ1P31415 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CASQ1P31415 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CASQ1P31415 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CASQ1P31415 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CASQ1P31415 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CASQ1P31415 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CASQ1P31415 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CASQ1P31415 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CASQ1P31415 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CASQ1P31415 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CASQ1P31415 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CASQ1P31415 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CASQ1P31415 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CASQ1P31415 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CASQ1P31415 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CASQ1P31415 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CASQ1P31415 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CASQ1P31415 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CASQ1P31415 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CASQ1P31415 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CASQ1P31415 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CASQ1P31415 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms