Protein–RNA interactions for Protein: P28074

PSMB5, Proteasome subunit beta type-5, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB5P28074 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PSMB5P28074 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PSMB5P28074 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PSMB5P28074 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PSMB5P28074 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PSMB5P28074 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PSMB5P28074 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PSMB5P28074 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PSMB5P28074 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PSMB5P28074 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PSMB5P28074 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PSMB5P28074 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PSMB5P28074 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PSMB5P28074 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PSMB5P28074 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PSMB5P28074 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PSMB5P28074 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PSMB5P28074 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PSMB5P28074 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PSMB5P28074 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PSMB5P28074 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PSMB5P28074 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PSMB5P28074 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PSMB5P28074 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PSMB5P28074 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PSMB5P28074 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PSMB5P28074 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PSMB5P28074 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PSMB5P28074 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PSMB5P28074 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PSMB5P28074 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PSMB5P28074 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PSMB5P28074 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PSMB5P28074 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PSMB5P28074 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PSMB5P28074 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PSMB5P28074 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PSMB5P28074 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PSMB5P28074 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PSMB5P28074 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PSMB5P28074 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PSMB5P28074 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PSMB5P28074 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PSMB5P28074 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PSMB5P28074 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PSMB5P28074 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PSMB5P28074 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PSMB5P28074 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PSMB5P28074 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PSMB5P28074 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PSMB5P28074 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PSMB5P28074 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PSMB5P28074 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PSMB5P28074 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PSMB5P28074 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PSMB5P28074 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PSMB5P28074 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PSMB5P28074 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PSMB5P28074 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PSMB5P28074 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PSMB5P28074 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PSMB5P28074 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PSMB5P28074 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PSMB5P28074 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PSMB5P28074 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PSMB5P28074 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PSMB5P28074 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PSMB5P28074 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PSMB5P28074 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PSMB5P28074 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PSMB5P28074 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PSMB5P28074 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PSMB5P28074 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PSMB5P28074 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PSMB5P28074 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PSMB5P28074 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PSMB5P28074 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PSMB5P28074 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PSMB5P28074 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PSMB5P28074 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PSMB5P28074 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PSMB5P28074 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PSMB5P28074 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PSMB5P28074 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PSMB5P28074 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PSMB5P28074 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PSMB5P28074 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PSMB5P28074 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PSMB5P28074 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PSMB5P28074 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PSMB5P28074 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PSMB5P28074 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PSMB5P28074 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PSMB5P28074 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PSMB5P28074 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PSMB5P28074 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PSMB5P28074 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PSMB5P28074 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PSMB5P28074 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PSMB5P28074 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms