Protein–RNA interactions for Protein: P24539

ATP5F1, ATP synthase F(0) complex subunit B1, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5F1P24539 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP5F1P24539 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP5F1P24539 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP5F1P24539 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP5F1P24539 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP5F1P24539 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP5F1P24539 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP5F1P24539 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP5F1P24539 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP5F1P24539 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP5F1P24539 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP5F1P24539 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP5F1P24539 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP5F1P24539 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP5F1P24539 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP5F1P24539 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP5F1P24539 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP5F1P24539 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP5F1P24539 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP5F1P24539 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP5F1P24539 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP5F1P24539 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP5F1P24539 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP5F1P24539 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP5F1P24539 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP5F1P24539 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP5F1P24539 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP5F1P24539 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP5F1P24539 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP5F1P24539 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP5F1P24539 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP5F1P24539 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP5F1P24539 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP5F1P24539 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP5F1P24539 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP5F1P24539 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP5F1P24539 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP5F1P24539 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP5F1P24539 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP5F1P24539 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP5F1P24539 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP5F1P24539 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP5F1P24539 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP5F1P24539 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP5F1P24539 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP5F1P24539 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP5F1P24539 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP5F1P24539 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP5F1P24539 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP5F1P24539 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP5F1P24539 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP5F1P24539 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP5F1P24539 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP5F1P24539 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP5F1P24539 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP5F1P24539 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP5F1P24539 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP5F1P24539 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP5F1P24539 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP5F1P24539 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP5F1P24539 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP5F1P24539 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP5F1P24539 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP5F1P24539 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP5F1P24539 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP5F1P24539 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP5F1P24539 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP5F1P24539 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP5F1P24539 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP5F1P24539 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP5F1P24539 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP5F1P24539 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP5F1P24539 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP5F1P24539 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP5F1P24539 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP5F1P24539 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP5F1P24539 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP5F1P24539 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP5F1P24539 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP5F1P24539 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP5F1P24539 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP5F1P24539 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP5F1P24539 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP5F1P24539 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP5F1P24539 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP5F1P24539 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP5F1P24539 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP5F1P24539 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP5F1P24539 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP5F1P24539 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP5F1P24539 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP5F1P24539 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP5F1P24539 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP5F1P24539 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP5F1P24539 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP5F1P24539 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP5F1P24539 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP5F1P24539 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP5F1P24539 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP5F1P24539 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59 ms