Protein–RNA interactions for Protein: P16619

CCL3L1, C-C motif chemokine 3-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL3L1P16619 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL3L1P16619 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL3L1P16619 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL3L1P16619 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL3L1P16619 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCL3L1P16619 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCL3L1P16619 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCL3L1P16619 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCL3L1P16619 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCL3L1P16619 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCL3L1P16619 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCL3L1P16619 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCL3L1P16619 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCL3L1P16619 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCL3L1P16619 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCL3L1P16619 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CCL3L1P16619 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCL3L1P16619 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCL3L1P16619 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCL3L1P16619 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCL3L1P16619 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCL3L1P16619 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCL3L1P16619 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCL3L1P16619 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCL3L1P16619 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCL3L1P16619 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCL3L1P16619 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CCL3L1P16619 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCL3L1P16619 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCL3L1P16619 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCL3L1P16619 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCL3L1P16619 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCL3L1P16619 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCL3L1P16619 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCL3L1P16619 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCL3L1P16619 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CCL3L1P16619 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCL3L1P16619 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCL3L1P16619 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCL3L1P16619 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCL3L1P16619 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCL3L1P16619 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCL3L1P16619 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCL3L1P16619 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCL3L1P16619 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCL3L1P16619 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCL3L1P16619 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCL3L1P16619 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCL3L1P16619 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCL3L1P16619 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CCL3L1P16619 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCL3L1P16619 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CCL3L1P16619 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CCL3L1P16619 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCL3L1P16619 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CCL3L1P16619 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCL3L1P16619 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCL3L1P16619 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CCL3L1P16619 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CCL3L1P16619 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CCL3L1P16619 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CCL3L1P16619 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCL3L1P16619 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCL3L1P16619 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCL3L1P16619 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCL3L1P16619 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCL3L1P16619 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCL3L1P16619 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCL3L1P16619 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCL3L1P16619 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCL3L1P16619 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCL3L1P16619 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCL3L1P16619 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCL3L1P16619 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCL3L1P16619 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCL3L1P16619 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCL3L1P16619 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CCL3L1P16619 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCL3L1P16619 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCL3L1P16619 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCL3L1P16619 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCL3L1P16619 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCL3L1P16619 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCL3L1P16619 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCL3L1P16619 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCL3L1P16619 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCL3L1P16619 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCL3L1P16619 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCL3L1P16619 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCL3L1P16619 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCL3L1P16619 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCL3L1P16619 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CCL3L1P16619 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCL3L1P16619 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCL3L1P16619 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCL3L1P16619 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCL3L1P16619 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCL3L1P16619 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCL3L1P16619 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCL3L1P16619 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.4 ms