Protein–RNA interactions for Protein: P12110

COL6A2, Collagen alpha-2(VI) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,019 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL6A2P12110 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
COL6A2P12110 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
COL6A2P12110 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
COL6A2P12110 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
COL6A2P12110 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
COL6A2P12110 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
COL6A2P12110 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
COL6A2P12110 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
COL6A2P12110 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
COL6A2P12110 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
COL6A2P12110 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
COL6A2P12110 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
COL6A2P12110 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
COL6A2P12110 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
COL6A2P12110 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
COL6A2P12110 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
COL6A2P12110 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
COL6A2P12110 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
COL6A2P12110 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
COL6A2P12110 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
COL6A2P12110 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
COL6A2P12110 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
COL6A2P12110 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
COL6A2P12110 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
COL6A2P12110 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
COL6A2P12110 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
COL6A2P12110 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
COL6A2P12110 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
COL6A2P12110 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
COL6A2P12110 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
COL6A2P12110 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
COL6A2P12110 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
COL6A2P12110 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
COL6A2P12110 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
COL6A2P12110 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
COL6A2P12110 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
COL6A2P12110 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
COL6A2P12110 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
COL6A2P12110 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
COL6A2P12110 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
COL6A2P12110 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
COL6A2P12110 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
COL6A2P12110 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
COL6A2P12110 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
COL6A2P12110 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
COL6A2P12110 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
COL6A2P12110 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
COL6A2P12110 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
COL6A2P12110 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
COL6A2P12110 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
COL6A2P12110 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
COL6A2P12110 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
COL6A2P12110 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
COL6A2P12110 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
COL6A2P12110 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
COL6A2P12110 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
COL6A2P12110 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
COL6A2P12110 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
COL6A2P12110 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
COL6A2P12110 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
COL6A2P12110 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
COL6A2P12110 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
COL6A2P12110 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
COL6A2P12110 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
COL6A2P12110 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
COL6A2P12110 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
COL6A2P12110 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
COL6A2P12110 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
COL6A2P12110 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
COL6A2P12110 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
COL6A2P12110 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
COL6A2P12110 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
COL6A2P12110 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
COL6A2P12110 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
COL6A2P12110 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
COL6A2P12110 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
COL6A2P12110 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
COL6A2P12110 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
COL6A2P12110 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
COL6A2P12110 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
COL6A2P12110 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
COL6A2P12110 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
COL6A2P12110 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
COL6A2P12110 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
COL6A2P12110 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
COL6A2P12110 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
COL6A2P12110 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
COL6A2P12110 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
COL6A2P12110 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
COL6A2P12110 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
COL6A2P12110 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
COL6A2P12110 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
COL6A2P12110 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
COL6A2P12110 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
COL6A2P12110 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
COL6A2P12110 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
COL6A2P12110 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
COL6A2P12110 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
COL6A2P12110 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
COL6A2P12110 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.3 ms