Protein–RNA interactions for Protein: P11279

LAMP1, Lysosome-associated membrane glycoprotein 1, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMP1P11279 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
LAMP1P11279 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LAMP1P11279 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
LAMP1P11279 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
LAMP1P11279 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LAMP1P11279 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
LAMP1P11279 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LAMP1P11279 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LAMP1P11279 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LAMP1P11279 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LAMP1P11279 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LAMP1P11279 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LAMP1P11279 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LAMP1P11279 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LAMP1P11279 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LAMP1P11279 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LAMP1P11279 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LAMP1P11279 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LAMP1P11279 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LAMP1P11279 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LAMP1P11279 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LAMP1P11279 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LAMP1P11279 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LAMP1P11279 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LAMP1P11279 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LAMP1P11279 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LAMP1P11279 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LAMP1P11279 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LAMP1P11279 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LAMP1P11279 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LAMP1P11279 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LAMP1P11279 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LAMP1P11279 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LAMP1P11279 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LAMP1P11279 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LAMP1P11279 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LAMP1P11279 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LAMP1P11279 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LAMP1P11279 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LAMP1P11279 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
LAMP1P11279 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LAMP1P11279 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LAMP1P11279 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LAMP1P11279 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LAMP1P11279 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LAMP1P11279 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LAMP1P11279 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LAMP1P11279 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LAMP1P11279 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LAMP1P11279 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LAMP1P11279 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LAMP1P11279 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LAMP1P11279 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LAMP1P11279 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LAMP1P11279 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LAMP1P11279 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LAMP1P11279 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LAMP1P11279 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LAMP1P11279 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LAMP1P11279 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LAMP1P11279 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LAMP1P11279 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LAMP1P11279 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LAMP1P11279 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LAMP1P11279 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LAMP1P11279 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LAMP1P11279 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LAMP1P11279 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LAMP1P11279 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LAMP1P11279 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LAMP1P11279 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LAMP1P11279 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LAMP1P11279 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LAMP1P11279 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LAMP1P11279 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LAMP1P11279 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LAMP1P11279 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LAMP1P11279 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LAMP1P11279 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LAMP1P11279 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LAMP1P11279 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LAMP1P11279 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LAMP1P11279 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LAMP1P11279 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
LAMP1P11279 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
LAMP1P11279 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
LAMP1P11279 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
LAMP1P11279 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
LAMP1P11279 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
LAMP1P11279 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
LAMP1P11279 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
LAMP1P11279 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LAMP1P11279 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LAMP1P11279 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LAMP1P11279 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LAMP1P11279 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LAMP1P11279 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LAMP1P11279 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LAMP1P11279 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LAMP1P11279 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms