Protein–RNA interactions for Protein: P0DN86

CGB3, Choriogonadotropin subunit beta 3, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGB3P0DN86 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CGB3P0DN86 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CGB3P0DN86 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CGB3P0DN86 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CGB3P0DN86 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CGB3P0DN86 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CGB3P0DN86 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CGB3P0DN86 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CGB3P0DN86 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CGB3P0DN86 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CGB3P0DN86 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CGB3P0DN86 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CGB3P0DN86 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CGB3P0DN86 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CGB3P0DN86 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CGB3P0DN86 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CGB3P0DN86 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CGB3P0DN86 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CGB3P0DN86 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CGB3P0DN86 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CGB3P0DN86 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CGB3P0DN86 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CGB3P0DN86 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CGB3P0DN86 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CGB3P0DN86 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CGB3P0DN86 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CGB3P0DN86 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CGB3P0DN86 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CGB3P0DN86 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CGB3P0DN86 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CGB3P0DN86 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CGB3P0DN86 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CGB3P0DN86 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CGB3P0DN86 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CGB3P0DN86 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CGB3P0DN86 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CGB3P0DN86 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CGB3P0DN86 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CGB3P0DN86 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CGB3P0DN86 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CGB3P0DN86 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CGB3P0DN86 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CGB3P0DN86 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CGB3P0DN86 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CGB3P0DN86 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CGB3P0DN86 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CGB3P0DN86 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CGB3P0DN86 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CGB3P0DN86 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CGB3P0DN86 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CGB3P0DN86 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CGB3P0DN86 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CGB3P0DN86 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CGB3P0DN86 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CGB3P0DN86 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CGB3P0DN86 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CGB3P0DN86 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CGB3P0DN86 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CGB3P0DN86 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CGB3P0DN86 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CGB3P0DN86 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CGB3P0DN86 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CGB3P0DN86 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CGB3P0DN86 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CGB3P0DN86 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CGB3P0DN86 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CGB3P0DN86 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CGB3P0DN86 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CGB3P0DN86 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CGB3P0DN86 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CGB3P0DN86 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CGB3P0DN86 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CGB3P0DN86 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CGB3P0DN86 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CGB3P0DN86 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CGB3P0DN86 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CGB3P0DN86 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CGB3P0DN86 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CGB3P0DN86 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CGB3P0DN86 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CGB3P0DN86 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CGB3P0DN86 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CGB3P0DN86 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CGB3P0DN86 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CGB3P0DN86 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CGB3P0DN86 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CGB3P0DN86 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CGB3P0DN86 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CGB3P0DN86 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CGB3P0DN86 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CGB3P0DN86 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CGB3P0DN86 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CGB3P0DN86 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CGB3P0DN86 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CGB3P0DN86 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CGB3P0DN86 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CGB3P0DN86 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CGB3P0DN86 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CGB3P0DN86 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CGB3P0DN86 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms