Protein–RNA interactions for Protein: P0DMS9

TMIGD3, Transmembrane domain-containing protein TMIGD3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD3P0DMS9 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMIGD3P0DMS9 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMIGD3P0DMS9 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMIGD3P0DMS9 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMIGD3P0DMS9 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMIGD3P0DMS9 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMIGD3P0DMS9 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMIGD3P0DMS9 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMIGD3P0DMS9 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMIGD3P0DMS9 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMIGD3P0DMS9 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
TMIGD3P0DMS9 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMIGD3P0DMS9 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMIGD3P0DMS9 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMIGD3P0DMS9 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMIGD3P0DMS9 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMIGD3P0DMS9 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMIGD3P0DMS9 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMIGD3P0DMS9 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMIGD3P0DMS9 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMIGD3P0DMS9 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMIGD3P0DMS9 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMIGD3P0DMS9 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMIGD3P0DMS9 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMIGD3P0DMS9 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMIGD3P0DMS9 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMIGD3P0DMS9 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMIGD3P0DMS9 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMIGD3P0DMS9 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMIGD3P0DMS9 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMIGD3P0DMS9 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMIGD3P0DMS9 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMIGD3P0DMS9 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMIGD3P0DMS9 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMIGD3P0DMS9 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMIGD3P0DMS9 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMIGD3P0DMS9 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMIGD3P0DMS9 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMIGD3P0DMS9 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMIGD3P0DMS9 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMIGD3P0DMS9 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
TMIGD3P0DMS9 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
TMIGD3P0DMS9 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMIGD3P0DMS9 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMIGD3P0DMS9 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMIGD3P0DMS9 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMIGD3P0DMS9 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMIGD3P0DMS9 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMIGD3P0DMS9 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMIGD3P0DMS9 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMIGD3P0DMS9 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMIGD3P0DMS9 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMIGD3P0DMS9 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMIGD3P0DMS9 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMIGD3P0DMS9 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMIGD3P0DMS9 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMIGD3P0DMS9 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMIGD3P0DMS9 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
TMIGD3P0DMS9 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
TMIGD3P0DMS9 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
TMIGD3P0DMS9 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
TMIGD3P0DMS9 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TMIGD3P0DMS9 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TMIGD3P0DMS9 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TMIGD3P0DMS9 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TMIGD3P0DMS9 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TMIGD3P0DMS9 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TMIGD3P0DMS9 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TMIGD3P0DMS9 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TMIGD3P0DMS9 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TMIGD3P0DMS9 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
TMIGD3P0DMS9 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TMIGD3P0DMS9 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TMIGD3P0DMS9 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TMIGD3P0DMS9 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TMIGD3P0DMS9 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TMIGD3P0DMS9 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TMIGD3P0DMS9 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TMIGD3P0DMS9 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TMIGD3P0DMS9 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TMIGD3P0DMS9 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TMIGD3P0DMS9 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TMIGD3P0DMS9 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TMIGD3P0DMS9 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TMIGD3P0DMS9 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TMIGD3P0DMS9 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
TMIGD3P0DMS9 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TMIGD3P0DMS9 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
TMIGD3P0DMS9 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TMIGD3P0DMS9 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TMIGD3P0DMS9 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TMIGD3P0DMS9 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
TMIGD3P0DMS9 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TMIGD3P0DMS9 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TMIGD3P0DMS9 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TMIGD3P0DMS9 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
TMIGD3P0DMS9 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TMIGD3P0DMS9 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TMIGD3P0DMS9 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TMIGD3P0DMS9 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms